36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4199 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4020  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4199  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4037  hypothetical protein  98.96 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3900  hypothetical protein  89.36 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4231  hypothetical protein  89.36 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0015  hypothetical protein  89.36 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4197  hypothetical protein  89.36 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03515  hypothetical protein  89.36 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0015  protein of unknown function DUF1375  89.36 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03571  conserved outer membrane protein  89.36 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4141  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4092  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0012  hypothetical protein  80.21 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.554308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5121  hypothetical protein  89.29 
 
 		 86 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.180552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4053  hypothetical protein  89.29 
 
 		 86 aa  160  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3915  protein of unknown function DUF1375  45.26 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0047  hypothetical protein  50.59 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.320831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0033  hypothetical protein  44.68 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4144  hypothetical protein  43.96 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3796  hypothetical protein  43.96 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0010  hypothetical protein  43.96 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0038  hypothetical protein  44.68 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4106  protein of unknown function DUF1375  42.71 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1181  hypothetical protein  36.92 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.731891  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1368  lipoprotein, putative  38.46 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00111167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1566  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.489739  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2279  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2079  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2549  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0255653  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1172  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.15827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1173  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0826653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1430  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.193761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01055  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0192844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2595  protein of unknown function DUF1375  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01047  predicted lipoprotein  38.46 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0125641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1056  hypothetical protein  32.98 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>