88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4105 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  99.41 
 
 
337 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  99.11 
 
 
337 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  99.11 
 
 
337 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  99.11 
 
 
337 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  100 
 
 
337 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  60.37 
 
 
335 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  54.6 
 
 
339 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  51.92 
 
 
338 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.92 
 
 
338 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.92 
 
 
338 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  51.92 
 
 
338 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.62 
 
 
338 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  52.21 
 
 
338 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  51.33 
 
 
338 aa  364  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  46.87 
 
 
336 aa  335  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  41.35 
 
 
337 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  37.74 
 
 
331 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.74 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.74 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.74 
 
 
331 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.42 
 
 
331 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  39.43 
 
 
336 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.4 
 
 
336 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.4 
 
 
336 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.1 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  40.58 
 
 
337 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  34.91 
 
 
341 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  34.91 
 
 
341 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  34.48 
 
 
342 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  34.59 
 
 
341 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  34.59 
 
 
341 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  34.28 
 
 
341 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  34.28 
 
 
341 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  33.12 
 
 
337 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  34.57 
 
 
338 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.49 
 
 
326 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
331 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  32.21 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  45 
 
 
167 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  25.77 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  25.09 
 
 
283 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  34.59 
 
 
163 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  25.95 
 
 
305 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  25.79 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  26.48 
 
 
328 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  26.22 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  26.56 
 
 
276 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  27.18 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  23.16 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  24.4 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  25.1 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  27.98 
 
 
401 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  24.51 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  28.36 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  25.8 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  26.25 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  24.45 
 
 
697 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  28.07 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.48 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
398 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  23.86 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  24.32 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0711  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
497 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 
630 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  25.7 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  20.93 
 
 
1014 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  23.49 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  21.94 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0060  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.69 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00709812  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  19.05 
 
 
273 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  23.84 
 
 
615 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2334  glycosyl transferase family protein  18.65 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2389  glycosyl transferase family protein  21.33 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.352127  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  21.3 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>