More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4100 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  98.95 
 
 		 381 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  99.21 
 
 		 381 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  100 
 
 		 381 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  98.69 
 
 		 381 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  98.43 
 
 		 381 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  56.84 
 
 		 380 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 		 425 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 446 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5426  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 899 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  32.1 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.69 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 453 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 448 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 536 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 438 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 438 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 419 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  28.17 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  29.57 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  33.53 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  31.19 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.22 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  31.55 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.19 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.77 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  23.87 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 495 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1916  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  31.22 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  30.57 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.76 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29460  Glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.565576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  27.6 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  21.07 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>