50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4040 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  99.7 
 
 
331 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  99.09 
 
 
331 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  100 
 
 
331 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  99.4 
 
 
331 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  98.79 
 
 
331 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  82.78 
 
 
331 aa  559  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  82.78 
 
 
331 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  82.18 
 
 
331 aa  554  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  82.48 
 
 
331 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  81.87 
 
 
331 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  81.87 
 
 
331 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  81.87 
 
 
331 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  81.87 
 
 
331 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  81.57 
 
 
331 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  58.61 
 
 
330 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  57.4 
 
 
330 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  59.21 
 
 
330 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  59.21 
 
 
330 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  58.61 
 
 
330 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  57.7 
 
 
330 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  29.1 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  29.1 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  29.1 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  29.43 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  28.76 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  24.35 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  23.78 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  31.85 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  24.78 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  24.78 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  33.1 
 
 
357 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  27.14 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  38.1 
 
 
375 aa  52.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  31.03 
 
 
379 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1141  hypothetical protein  23.66 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  hitchhiker  0.0000472475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  26.1 
 
 
376 aa  49.7  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  24.6 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  26.09 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  28.48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0110  hypothetical protein  24.1 
 
 
346 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  24.54 
 
 
374 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3266  acyltransferase 3  36.11 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1862  hypothetical protein  24.88 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.378976  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2961  hypothetical protein  24.88 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3034  hypothetical protein  24.88 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  24.11 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  31.43 
 
 
389 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  24.85 
 
 
384 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  24.03 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1833  acyltransferase 3  36.11 
 
 
371 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>