120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3951 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  99.55 
 
 
221 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  99.1 
 
 
221 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  99.1 
 
 
246 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  90.05 
 
 
221 aa  407  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  90.05 
 
 
221 aa  407  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  89.59 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  89.59 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  89.59 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  89.59 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  89.59 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  89.59 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  89.59 
 
 
221 aa  400  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  89.14 
 
 
221 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  74.18 
 
 
225 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  73.39 
 
 
221 aa  332  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  74.65 
 
 
223 aa  330  8e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  73.24 
 
 
225 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  74.18 
 
 
222 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  74.18 
 
 
222 aa  326  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  74.18 
 
 
222 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  74.3 
 
 
222 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  71.9 
 
 
224 aa  305  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  71.77 
 
 
223 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  71.43 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  68.69 
 
 
221 aa  295  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  65.9 
 
 
227 aa  293  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  63.68 
 
 
224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  62.68 
 
 
219 aa  265  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  64.29 
 
 
217 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  63.92 
 
 
216 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  58.41 
 
 
223 aa  256  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  58.41 
 
 
222 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  61.31 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  58.77 
 
 
221 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  59.33 
 
 
226 aa  251  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  58.53 
 
 
222 aa  251  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  58.06 
 
 
222 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  58.85 
 
 
219 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000918531  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  58.85 
 
 
219 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  58.85 
 
 
219 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000298941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  58.85 
 
 
219 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  56.94 
 
 
219 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  56.88 
 
 
236 aa  246  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  57.89 
 
 
219 aa  244  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  59 
 
 
219 aa  244  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  56.54 
 
 
219 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  60 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  60 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  60 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  59.49 
 
 
219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  47.76 
 
 
225 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  48.47 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  34.84 
 
 
210 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  37.29 
 
 
181 aa  98.2  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  31.96 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  36 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  32.86 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  32.86 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  33.94 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  32.38 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  34.13 
 
 
207 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  34.55 
 
 
210 aa  92  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  30.91 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  37.84 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  33.03 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  30.2 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  33.98 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  37.29 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  35.33 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  42.25 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  34.76 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  31.05 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  28.81 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  30.94 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  27.1 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  27.57 
 
 
262 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  31.67 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  31.67 
 
 
234 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  27.81 
 
 
263 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  25.51 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  32.64 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  30.54 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  30.77 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  32 
 
 
219 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  29.33 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  27.6 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  27.17 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  27.6 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  26.29 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  27.85 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  34.15 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  26.7 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  26.26 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  27.96 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  28.31 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  27.96 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>