More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3602 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3506  threonine dehydratase  99.7 
 
 		 329 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3602  threonine dehydratase  100 
 
 		 329 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3539  threonine dehydratase  99.7 
 
 		 329 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00163646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3435  threonine dehydratase  100 
 
 		 329 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3432  threonine dehydratase  99.7 
 
 		 329 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02984  threonine dehydratase  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0586  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02935  hypothetical protein  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3240  threonine dehydratase  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4430  threonine dehydratase  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.119659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3591  threonine dehydratase  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3305  threonine dehydratase  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0581  threonine dehydratase  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3413  threonine dehydratase  95.14 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  91.19 
 
 		 329 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  58.57 
 
 		 333 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  58.57 
 
 		 333 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  58.26 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  58.57 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  58.26 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  58.26 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  58.26 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  58.57 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  54.6 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  54.6 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  58.26 
 
 		 333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  48.9 
 
 		 403 aa  315  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  47.99 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  46.13 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.49 
 
 		 403 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  46.27 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  44.41 
 
 		 402 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  44.09 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  49.54 
 
 		 401 aa  275  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  49.54 
 
 		 401 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  44.27 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  44.3 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  46.5 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  47.47 
 
 		 358 aa  268  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.65 
 
 		 403 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43.32 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  41.77 
 
 		 403 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  46.96 
 
 		 402 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.41 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  47.06 
 
 		 402 aa  263  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.63 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  46.62 
 
 		 401 aa  262  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  43.81 
 
 		 403 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  43.81 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  46.96 
 
 		 402 aa  259  4e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  47.17 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  44.86 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  44.69 
 
 		 412 aa  255  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  42.45 
 
 		 403 aa  255  7e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  47.19 
 
 		 403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  44.94 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.58 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.18 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  45.03 
 
 		 403 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  41.46 
 
 		 408 aa  248  7e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  45.25 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  48.28 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  50.84 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  42.22 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  47.4 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  45.51 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  44.23 
 
 		 403 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 403 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  46.1 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  48.06 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  40.13 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  47.48 
 
 		 402 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  43.69 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  43.51 
 
 		 406 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  45.51 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  47.69 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.24 
 
 		 320 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  45.71 
 
 		 413 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  46.1 
 
 		 411 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  43.6 
 
 		 537 aa  236  6e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  42.26 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.45 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.86 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  40.06 
 
 		 501 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  40.51 
 
 		 504 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  40.51 
 
 		 504 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  46.1 
 
 		 404 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  39.74 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  46.82 
 
 		 410 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  37.58 
 
 		 520 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  44.52 
 
 		 403 aa  231  9e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.64 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  44.76 
 
 		 401 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41.42 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  42.3 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  45.45 
 
 		 411 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>