152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3356 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02693  predicted transporter  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0845  serine transporter  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3356  inner membrane transport protein YqeG  100 
 
 
409 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3302  spore germination protein  83.37 
 
 
409 aa  708    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02656  hypothetical protein  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2992  serine transporter family protein  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000482525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3240  inner membrane transport protein YqeG  99.76 
 
 
409 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3167  serine transporter family protein  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3191  inner membrane transport protein YqeG  99.51 
 
 
409 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3175  inner membrane transport protein YqeG  100 
 
 
409 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0870  serine transporter  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2993  serine transporter family protein  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.07384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4114  serine transporter family protein  90.2 
 
 
409 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3015  serine transporter family protein  89.95 
 
 
409 aa  751    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3254  inner membrane transport protein YqeG  99.51 
 
 
409 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0329788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2139  serine transporter  40.98 
 
 
427 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41295  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1339  serine transporter  39.32 
 
 
429 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2939  serine transporter  39.56 
 
 
429 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.557142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1550  serine transporter  37.5 
 
 
440 aa  292  8e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2656  serine transporter  37.26 
 
 
433 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2739  serine transporter  37.26 
 
 
433 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1630  serine transporter  37.89 
 
 
431 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.80045  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02641  predicted serine transporter  39.28 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0892  serine transporter  39.28 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02603  hypothetical protein  39.28 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2940  serine transporter family protein  39.28 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.271081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4060  serine transporter family protein  39.28 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0533017  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1242  serine transporter  38.54 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0363509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2936  serine transporter family protein  39.28 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0834253  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3101  serine transporter family protein  38.5 
 
 
429 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.41481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0916  serine transporter  39.28 
 
 
429 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3130  serine transporter family protein  39.81 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805755  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3293  serine transporter family protein  39.81 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.412902  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3178  serine transporter family protein  39.81 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.509174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3113  serine transporter family protein  39.81 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3193  serine transporter family protein  39.81 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3076  serine transporter family protein  39.04 
 
 
429 aa  282  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.119779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2241  hypothetical protein  37.86 
 
 
431 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2269  hypothetical protein  37.86 
 
 
431 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3396  aromatic amino acid permease  37.99 
 
 
426 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2666  serine transporter  36.89 
 
 
427 aa  279  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.973532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2397  putative serine transporter  36.1 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2804  amino acid transporter transmembrane  38.86 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3149  putative serine transporter  36.59 
 
 
430 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3249  serine transporter  38.65 
 
 
429 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416009  normal  0.367748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2327  aromatic amino acid permease  37.31 
 
 
426 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2183  aromatic amino acid permease  37.31 
 
 
426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3589  aromatic amino acid ABC transporter permease  37.31 
 
 
426 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3633  threonine/serine transporter  35.29 
 
 
425 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0919  serine transporter  35.85 
 
 
433 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0863  aromatic amino acid permease  36.83 
 
 
423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0739  aromatic amino acid permease  36.34 
 
 
423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1760  threonine/serine transporter  35.14 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0858  aromatic amino acid permease  37.14 
 
 
423 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2772  amino acid transporter, transmembrane  36.59 
 
 
438 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001600  serine transporter  37.16 
 
 
418 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05580  hypothetical protein  35.7 
 
 
418 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3262  amino acid transporter, transmembrane  35.59 
 
 
430 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3286  serine/threonine transporter family protein  34.64 
 
 
439 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3066  serine/threonine transporter family protein  34.4 
 
 
439 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3306  serine/threonine transporter family protein  34.4 
 
 
439 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3207  serine/threonine transporter family protein  35.14 
 
 
439 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2484  serine/threonine transporter family protein  34.64 
 
 
439 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5569  aromatic amino acid permease  35.31 
 
 
439 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.179015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3552  aromatic amino acid permease  36.01 
 
 
431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3674  aromatic amino acid permease  36.01 
 
 
431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3483  aromatic amino acid permease  36.01 
 
 
431 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0765  aromatic amino acid permease  36.01 
 
 
431 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0761  amino acid transporter, transmembrane  35.35 
 
 
430 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3365  serine transporter, putative  35.59 
 
 
430 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1262  serine transporter  36.67 
 
 
417 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.040396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0861  aromatic amino acid permease  35.32 
 
 
431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3146  aromatic amino acid permease  35.04 
 
 
439 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0919  serine transporter, putative  35.11 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3416  serine transporter  34.89 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3415  serine/threonine transporter family protein  35.11 
 
 
439 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3177  serine transporter  35.11 
 
 
439 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1840  serine/threonine transporter family protein  35.11 
 
 
439 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.781271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3106  serine transporter  35.11 
 
 
439 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3407  serine/threonine transporter family protein  35.11 
 
 
439 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3427  serine/threonine transporter family protein  35.11 
 
 
439 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3198  serine/threonine transporter family protein  35.11 
 
 
439 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0885914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3451  serine/threonine transporter family protein  35.11 
 
 
439 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.305913  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0423  serine transporter  34.79 
 
 
413 aa  229  7e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0771  aromatic amino acid permease  34.47 
 
 
428 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2127  serine transporter, putative  34.78 
 
 
453 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0919  serine transporter  33.17 
 
 
417 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0688  aromatic amino acid permease  35.57 
 
 
419 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003156  serine transporter  34.06 
 
 
417 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01909  hypothetical protein  33.5 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1616  serine transporter  35.54 
 
 
416 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.973383  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1985  serine transporter  31.89 
 
 
440 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0582  threonine/serine transporter TdcC  32.38 
 
 
443 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.090832  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3412  threonine/serine transporter TdcC  32.38 
 
 
443 aa  210  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02983  L-threonine/L-serine transporter  32.38 
 
 
443 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0587  serine transporter  32.38 
 
 
443 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4429  threonine/serine transporter TdcC  32.38 
 
 
443 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0929595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3304  threonine/serine transporter TdcC  32.38 
 
 
443 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.078969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3590  threonine/serine transporter TdcC  32.38 
 
 
443 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02934  hypothetical protein  32.38 
 
 
443 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>