129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3241 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3241  cell division protein FtsB  100 
 
 
103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3121  cell division protein FtsB  100 
 
 
103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3056  cell division protein FtsB  100 
 
 
103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3082  cell division protein FtsB  100 
 
 
103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3137  cell division protein FtsB  100 
 
 
103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.0827002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3126  cell division protein FtsB  92.23 
 
 
103 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02598  cell diviision protein FtsB  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0940  Septum formation initiator  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02563  hypothetical protein  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3999  cell division protein FtsB  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2886  cell division protein FtsB  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3049  cell division protein FtsB  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0964  cell division protein FtsB  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.429891  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2873  cell division protein FtsB  91.26 
 
 
103 aa  174  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.736595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3219  cell division protein FtsB  89.32 
 
 
103 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0825  cell division protein FtsB  83.5 
 
 
106 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.299697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0866  cell division protein FtsB  78.57 
 
 
115 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0835  cell division protein FtsB  77.55 
 
 
117 aa  147  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3300  cell division protein FtsB  77.45 
 
 
106 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0965  cell division protein FtsB  77.45 
 
 
106 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3432  cell division protein FtsB  77.45 
 
 
106 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3511  cell division protein FtsB  79.59 
 
 
111 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3354  cell division protein FtsB  77.23 
 
 
111 aa  143  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2513  cell division protein FtsB homolog  55.91 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.77414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03524  cell division protein FtsB  56.67 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002509  cell division protein FtsB  53.26 
 
 
93 aa  106  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000404071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0671  septum formation initiator  50.56 
 
 
92 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0137843  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1071  septum formation initiator family protein  60.81 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1495  cell division protein FtsB  48.39 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3856  septum formation initiator  51.11 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0137964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1291  septum formation initiator  52.27 
 
 
99 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000132598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1186  septum formation initiator  51.14 
 
 
98 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1187  cell division protein FtsB  53.41 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0200308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1117  cell division protein FtsB  53.41 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3439  hypothetical protein  53.41 
 
 
99 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1116  cell division protein FtsB  53.41 
 
 
99 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372931  normal  0.865304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3126  septum formation initiator  52.27 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.161431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3135  septum formation initiator  52.27 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3278  septum formation initiator  52.27 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115977  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1238  Septum formation initiator  52.27 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00877838  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0055  cell division protein FtsB  53.95 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1908  cell division protein FtsB  46.23 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.46013  normal  0.669467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03720  septum formation initiator family protein  57.69 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1206  septum formation initiator  43 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000148323  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2756  septum formation initiator  51.14 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1037  cell division protein FtsB  45.98 
 
 
105 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3349  septum formation initiator  53.33 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000140943  hitchhiker  0.00000175822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1246  cell division protein FtsB  43.33 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0420044  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1053  septum formation initiator  54.79 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1453  cell division protein FtsB  50.65 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00170  cell division protein FtsB  46.51 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0622  cell division protein FtsB  43.43 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1688  cell division protein FtsB  41.41 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000947762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2710  cell division protein FtsB  41.41 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2192  cell division protein FtsB  41.41 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0728748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3126  cell division protein FtsB  41.41 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.679359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2576  cell division protein FtsB  41.41 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2630  cell division protein FtsB  41.41 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1465  cell division protein FtsB  41.41 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0328  cell division protein  50.68 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1864  cell division protein ftsB  50.68 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1229  septum formation initiator  49.35 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1895  cell division protein FtsB  41.18 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3032  cell division protein FtsB  45.24 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528115  hitchhiker  0.0020798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1663  septum formation initiator  39.39 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000362225  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1092  cell division protein FtsB  46.99 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0617  cell division protein FtsB  45.33 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.740532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5412  cell division protein FtsB  42.71 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5971  cell division protein FtsB  43.01 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2106  cell division protein FtsB  43.01 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1300  septum formation initiator  38.2 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2124  cell division protein FtsB  43.01 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199661  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0569  cell division protein FtsB  45.33 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1664  Septum formation initiator  47.22 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1056  cell division protein FtsB  46.99 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0948  septum formation initiator  40.66 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1069  cell division protein FtsB  45.78 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0318895  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2143  cell division protein FtsB  40 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2016  cell division protein FtsB  40 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0973  cell division protein FtsB  45.78 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108373  normal  0.0382578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2021  hypothetical protein  38.64 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2016  hypothetical protein  38.64 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3185  cell division protein FtsB  39.51 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.389841  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2639  cell division protein FtsB  42.86 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3447  Septum formation initiator  40.28 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1130  cell division protein FtsB  44.58 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2651  septum formation initiator  35.96 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1574  cell division protein FtsB  39.36 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0501126  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1185  Septum formation initiator  43.84 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1122  cell division protein FtsB  43.06 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0997636  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1197  septum formation initiator  50 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00450437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17330  hypothetical protein  40.48 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1505  hypothetical protein  40.48 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0850  septum formation initiator family protein  38.1 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0976  Septum formation initiator  38.1 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0407513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4062  septum formation initiator  41.67 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2559  cell division protein FtsB  38.14 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238531  normal  0.205599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2363  cell division protein FtsB  44.83 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.685194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1838  cell division protein FtsB  45.83 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0739072  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0896  Septum formation initiator  40.24 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.478298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>