More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3091 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  87.68 
 
 
422 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  88.15 
 
 
422 aa  762    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  98.82 
 
 
422 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  100 
 
 
422 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  87.2 
 
 
422 aa  758    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  99.76 
 
 
422 aa  871    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  99.29 
 
 
422 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  99.53 
 
 
422 aa  871    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  87.91 
 
 
422 aa  759    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  87.91 
 
 
422 aa  759    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  87.68 
 
 
422 aa  756    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  88.15 
 
 
422 aa  763    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  88.15 
 
 
422 aa  759    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  87.91 
 
 
422 aa  761    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  72.66 
 
 
425 aa  579  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  72.01 
 
 
416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  72.01 
 
 
416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  71.76 
 
 
416 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  56.09 
 
 
407 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  59.03 
 
 
399 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  56.78 
 
 
416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  56.03 
 
 
397 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  55.81 
 
 
408 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  55.7 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  55.61 
 
 
398 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  55.7 
 
 
403 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  53.05 
 
 
398 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  51.65 
 
 
397 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  48.36 
 
 
402 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  48.36 
 
 
402 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  51.36 
 
 
403 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  51.28 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  51.4 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  51.4 
 
 
404 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  50.64 
 
 
406 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  50.64 
 
 
396 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  51.02 
 
 
410 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  50.63 
 
 
400 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  49.49 
 
 
409 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 
407 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  47.07 
 
 
404 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  47.58 
 
 
400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.12 
 
 
399 aa  360  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 
409 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  44.33 
 
 
400 aa  346  6e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  44.33 
 
 
399 aa  342  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  43.75 
 
 
398 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  44.22 
 
 
403 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.58 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  45.23 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 
406 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  40.66 
 
 
427 aa  306  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  43.32 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  42.44 
 
 
396 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 
412 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
442 aa  299  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 
401 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  42.09 
 
 
396 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  37.59 
 
 
427 aa  292  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  39.65 
 
 
625 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  39.43 
 
 
398 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 
400 aa  280  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
399 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  38.96 
 
 
400 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  40.05 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
403 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  54.36 
 
 
245 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
405 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
406 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.02 
 
 
403 aa  183  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
408 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  29.66 
 
 
409 aa  176  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
437 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
399 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
399 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
362 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.57 
 
 
366 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
371 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
364 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
370 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
366 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.65 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.15 
 
 
373 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
376 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
373 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
374 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.65 
 
 
373 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  27.56 
 
 
383 aa  133  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
373 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
378 aa  133  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.65 
 
 
373 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.65 
 
 
373 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.65 
 
 
373 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  27.72 
 
 
489 aa  132  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
368 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
369 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>