288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2955 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  99.21 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  94.44 
 
 		 126 aa  243  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  94.44 
 
 		 126 aa  243  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  94.44 
 
 		 126 aa  243  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  94.44 
 
 		 126 aa  243  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  94.44 
 
 		 126 aa  243  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.65 
 
 		 126 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.65 
 
 		 126 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  94.44 
 
 		 126 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  94.44 
 
 		 126 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  93.65 
 
 		 126 aa  240  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  84.13 
 
 		 126 aa  216  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  82.54 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  78.57 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  78.57 
 
 		 126 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  77.78 
 
 		 126 aa  200  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  76 
 
 		 126 aa  200  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  74.4 
 
 		 126 aa  196  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  74.6 
 
 		 126 aa  193  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  61.6 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  57.14 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.28 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.61 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.97 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.78 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.97 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.17 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.17 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2925  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.56 
 
 		 126 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  42.74 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1282  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0790463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.39 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1163  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.211721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3022  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.12 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0398332  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2844  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.33 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.712393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2926  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.33 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1352  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1247  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.91 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019749  unclonable  0.0000000106801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1041  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.54 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2762  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.33 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1152  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1058  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0868  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.78 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0432796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1012  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.78 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.06 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.13 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.77 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.44 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.28 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.83 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  43.2 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.02 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.67 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.32 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.68 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.4 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.9 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.71 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.75 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1351  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.61 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0301322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.76 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.52 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.13 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.55 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.83 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.21 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.09 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0796  Holo-acyl carrier protein synthase  47.54 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1943  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.94 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>