272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2859 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  100 
 
 		 422 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  100 
 
 		 422 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  100 
 
 		 422 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  100 
 
 		 422 aa  808    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  76.54 
 
 		 422 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  76.54 
 
 		 422 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  76.3 
 
 		 422 aa  588  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  80.09 
 
 		 421 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  72.86 
 
 		 421 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  65.87 
 
 		 419 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  65.87 
 
 		 419 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  67.07 
 
 		 424 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  55.89 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  45.69 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  45.12 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  43.09 
 
 		 431 aa  332  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  26.8 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  24.76 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  29.53 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  29.53 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  29.53 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  29.53 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  29.53 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  24 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  25.66 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  25.66 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  25.59 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  28.42 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  31.14 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1484  gluconate transporter  23.64 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  25.25 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  28.15 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  23.15 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  24.73 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2780  gluconate transporter  24.03 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  25.31 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  24.4 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  23.52 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  23.52 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  23.52 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  23.52 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3565  gluconate permease  23.53 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  25.29 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  23.29 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  27.06 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  23.87 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  25.86 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4335  gluconate transporter  23.5 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  22.49 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  25 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  25 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  23.4 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  25 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  25 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  25 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  23.53 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  25 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3027  gluconate transporter  22.69 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  25.33 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  26.32 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0693  fructuronate transporter  24.04 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  23.51 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0665  gluconate permease  26.09 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.843783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  23.75 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0762  fructuronate transporter  24.45 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0733175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  23.75 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1347  gluconate transporter family protein  26.67 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  23.22 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3338  gluconate transporter  22.97 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.622488  hitchhiker  0.000717013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3977  gluconate transporter  25.26 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0667  gluconate transporter  23.03 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  24.36 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  27.42 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  27.42 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1158  gluconate transporter  26.69 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.956779 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6142  gluconate transporter  23.94 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0156106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  26.55 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  27.42 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  26.21 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  27.42 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  27.42 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  24.3 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  21.91 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  25.37 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  27.42 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  21.57 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  21.57 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  27.96 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  27.59 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  23.77 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  27.59 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  25.93 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  21.57 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  21.91 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  22.84 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  22.39 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  21.91 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4787  gluconate transporter  24.65 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  23.52 
 
 		 439 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>