More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2671 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2553  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
166 aa  349  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2671  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
166 aa  349  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  0.621084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2564  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
166 aa  349  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2509  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
166 aa  349  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2464  NADH dehydrogenase subunit E  100 
 
 
166 aa  349  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02210  NADH dehydrogenase subunit E  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1372  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00570397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1367  NADH dehydrogenase subunit E  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.334565  normal  0.707376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02170  hypothetical protein  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2434  NADH dehydrogenase subunit E  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2661  NADH dehydrogenase subunit E  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0294149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2578  NADH dehydrogenase subunit E  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2439  NADH dehydrogenase subunit E  96.99 
 
 
166 aa  340  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3424  NADH dehydrogenase subunit E  96.39 
 
 
166 aa  337  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208277  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2829  NADH dehydrogenase subunit E  95.18 
 
 
166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0584484  normal  0.465649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3305  NADH dehydrogenase subunit E  87.58 
 
 
183 aa  299  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00437107  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1563  NADH dehydrogenase subunit E  89.1 
 
 
187 aa  297  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2547  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  86.34 
 
 
176 aa  295  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1495  NADH dehydrogenase subunit E  85.53 
 
 
181 aa  292  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2769  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  81.33 
 
 
171 aa  290  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1397  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  83.85 
 
 
176 aa  289  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28470  NADH dehydrogenase subunit E  73.46 
 
 
164 aa  248  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29980  NADH dehydrogenase subunit E  69.09 
 
 
166 aa  246  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2567  NADH dehydrogenase subunit E  68.48 
 
 
166 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3606  NADH dehydrogenase subunit E  70.25 
 
 
165 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1870  NADH dehydrogenase subunit E  70.89 
 
 
165 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.142581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1018  NADH dehydrogenase subunit E  74.03 
 
 
180 aa  243  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4122  NADH dehydrogenase subunit E  70.25 
 
 
165 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3694  NADH dehydrogenase subunit E  70.25 
 
 
165 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0959076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1743  NADH dehydrogenase subunit E  70.25 
 
 
165 aa  240  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.048618  normal  0.210443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3200  NADH dehydrogenase subunit E  68.99 
 
 
165 aa  238  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333269  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3368  NADH dehydrogenase I, E subunit  68.99 
 
 
165 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0378  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  72.73 
 
 
167 aa  237  5.999999999999999e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2415  NADH dehydrogenase subunit E  70.25 
 
 
170 aa  236  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144111  normal  0.147361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3129  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  61.78 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0576  NADH dehydrogenase subunit E  54.88 
 
 
169 aa  198  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0587  NADH dehydrogenase subunit E  54.27 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1696  NADH dehydrogenase subunit E  57.24 
 
 
170 aa  193  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.142144  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3822  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  51.97 
 
 
154 aa  167  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.144781  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1124  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  50.33 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1016  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  50.98 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.664946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1117  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  52.03 
 
 
165 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1356  NADH dehydrogenase subunit E  43.62 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2863  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  40.65 
 
 
179 aa  138  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.088948  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0332  NADH dehydrogenase subunit E  45.93 
 
 
157 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0715  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  45.19 
 
 
164 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3443  NADH dehydrogenase subunit E  43.7 
 
 
162 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0096  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.94 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  40.52 
 
 
162 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1956  NADH dehydrogenase subunit E  41.78 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131976  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0154  NADH dehydrogenase subunit E  41.01 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1350  NADH dehydrogenase subunit E  43.28 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1329  NADH dehydrogenase subunit E  42.54 
 
 
157 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116663  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1692  NADH dehydrogenase subunit E  43.28 
 
 
157 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0103  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
157 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1739  NADH dehydrogenase subunit E  40.97 
 
 
157 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  42.64 
 
 
149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0177  NADH dehydrogenase subunit E  41.35 
 
 
156 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0207  NADH dehydrogenase subunit E  40.91 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1886  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.61 
 
 
159 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1396  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.49 
 
 
160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  40.31 
 
 
157 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0159  NADH dehydrogenase subunit E  39.1 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.458445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1339  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  37.24 
 
 
155 aa  110  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1025  Fe-hydrogenase, gamma subunit  39.86 
 
 
148 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2832  NADH dehydrogenase I chain E  39.01 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2701  NADH dehydrogenase I chain E  39.01 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_153  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  35.81 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3506  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.91 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1829  Fe-hydrogenase, gamma subunit  41.3 
 
 
148 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0492  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.44 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
163 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.36 
 
 
163 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0833  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  39.57 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.36 
 
 
224 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0145  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  35.14 
 
 
155 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.702609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0226  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  35.14 
 
 
155 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0558  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  37.32 
 
 
161 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.808339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0916  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.67 
 
 
162 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0783  NADH dehydrogenase I chain E  35.97 
 
 
148 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3619  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.49 
 
 
169 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  49.54 
 
 
153 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1146  NADH dehydrogenase subunit E  38.41 
 
 
168 aa  104  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0929522  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02960  NADH dehydrogenase I subunit E  35.38 
 
 
136 aa  103  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0806  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  39.42 
 
 
149 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.65 
 
 
176 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24660  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit  33.08 
 
 
162 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  36.54 
 
 
260 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1247  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.97 
 
 
158 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0560002  normal  0.0336661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  38.06 
 
 
151 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0165  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.96 
 
 
175 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1653  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  36.15 
 
 
158 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0632  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.52 
 
 
154 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1627  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.52 
 
 
154 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3189  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.52 
 
 
154 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0227  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  36.62 
 
 
157 aa  101  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00462802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.51 
 
 
162 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0215  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  31.97 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.44 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  31.68 
 
 
239 aa  99  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>