49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2564 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2564  inner membrane protein YeiU  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00168101  hitchhiker  0.0000332566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2362  inner membrane protein YeiU  99.6 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000283776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2407  inner membrane protein YeiU  99.6 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000750111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2453  inner membrane protein YeiU  99.19 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00121295  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2450  hypothetical protein  99.19 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  hitchhiker  0.0000000794729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2472  PAP2 family protein  83.48 
 
 		 237 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1483  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  83.48 
 
 		 237 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3312  PAP2 family protein  83.48 
 
 		 237 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  0.0360281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2323  PAP2 family protein  83.48 
 
 		 237 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.00704266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02104  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  82.61 
 
 		 237 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2312  PAP2 family protein  82.61 
 
 		 237 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.503655  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1473  phosphoesterase PA-phosphatase related  82.61 
 
 		 237 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000602419  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0784  PAP2 family protein  82.17 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02063  hypothetical protein  82.61 
 
 		 237 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2770  phosphoesterase, PA-phosphatase related  76.25 
 
 		 240 aa  356  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1647  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.11 
 
 		 233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3242  phosphoesterase PA-phosphatase related  65.52 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  66.22 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  63.51 
 
 		 234 aa  278  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1502  hypothetical protein  62.26 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2783  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.79 
 
 		 233 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2706  PAP2 family protein  61.79 
 
 		 233 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.44 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0266  hypothetical protein  29.49 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5938  hypothetical protein  31.84 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68620  hypothetical protein  30.85 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4961  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.13 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000885099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0366  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0276  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.06 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0251  hypothetical protein  27.78 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0266  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.31 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  24 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.7 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.7 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.7 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.75 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.7 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.68 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.07 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.84 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.84 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>