238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2543 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2543  S-formylglutathione hydrolase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420997  normal  0.167647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2340  S-formylglutathione hydrolase  99.65 
 
 
285 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2429  S-formylglutathione hydrolase  99.65 
 
 
285 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2433  S-formylglutathione hydrolase  99.3 
 
 
285 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2385  S-formylglutathione hydrolase  99.65 
 
 
285 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.72074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02083  predicted esterase  87.68 
 
 
278 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1504  S-formylglutathione hydrolase  87.68 
 
 
278 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0638079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0812  S-formylglutathione hydrolase  87.68 
 
 
278 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.631287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1494  S-formylglutathione hydrolase  87.68 
 
 
278 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02042  hypothetical protein  87.68 
 
 
278 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3289  S-formylglutathione hydrolase  87.68 
 
 
278 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.795091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2450  S-formylglutathione hydrolase  87.68 
 
 
278 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2288  S-formylglutathione hydrolase  87.68 
 
 
278 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2301  S-formylglutathione hydrolase  86.96 
 
 
278 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.014444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  81.52 
 
 
278 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  75.72 
 
 
280 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  70.04 
 
 
280 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  73.48 
 
 
281 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2474  S-formylglutathione hydrolase  71.84 
 
 
280 aa  414  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1556  S-formylglutathione hydrolase  72.46 
 
 
280 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  68.23 
 
 
281 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3010  S-formylglutathione hydrolase  71.12 
 
 
280 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182867  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2572  S-formylglutathione hydrolase  71.12 
 
 
280 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  60.29 
 
 
279 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  60.07 
 
 
281 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  59.35 
 
 
278 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  62.72 
 
 
283 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  61.01 
 
 
279 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1838  putative esterase  59.86 
 
 
279 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.236801 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  61.01 
 
 
279 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  60.65 
 
 
279 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1787  carboxylesterase  59.14 
 
 
279 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2190  carboxylesterase  59.14 
 
 
279 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  58.78 
 
 
279 aa  360  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  59.35 
 
 
283 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  58.63 
 
 
289 aa  358  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  58.48 
 
 
276 aa  357  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  56.94 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  59.57 
 
 
279 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  58.06 
 
 
280 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  58.36 
 
 
289 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1828  carboxylesterase  59.35 
 
 
298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0463121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  61.65 
 
 
283 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  61.96 
 
 
281 aa  356  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  58.06 
 
 
280 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  60.93 
 
 
280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  59.71 
 
 
285 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  57.71 
 
 
280 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  57.19 
 
 
279 aa  353  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  60.43 
 
 
282 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  57.35 
 
 
280 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  61.51 
 
 
276 aa  352  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  59.64 
 
 
281 aa  352  5e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  58.84 
 
 
283 aa  352  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2173  carboxylesterase  57.35 
 
 
280 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  60.14 
 
 
284 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  60.14 
 
 
284 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  58.21 
 
 
281 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  58.78 
 
 
284 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  58.63 
 
 
281 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  59.78 
 
 
284 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4023  carboxylesterase  59.79 
 
 
287 aa  349  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  57.76 
 
 
279 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  58.42 
 
 
281 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  59.5 
 
 
282 aa  344  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  58.06 
 
 
281 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  60.79 
 
 
278 aa  342  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  57.25 
 
 
276 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  57.04 
 
 
276 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  56.12 
 
 
276 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03627  Carboxylesterase  57.35 
 
 
280 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  55.56 
 
 
283 aa  334  7.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  56.83 
 
 
280 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0380  S-formylglutathione hydrolase  54.51 
 
 
277 aa  331  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0386  S-formylglutathione hydrolase  54.15 
 
 
277 aa  329  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0420  S-formylglutathione hydrolase  54.15 
 
 
277 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0430  S-formylglutathione hydrolase  53.79 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00309  predicted esterase  53.79 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3251  S-formylglutathione hydrolase  53.79 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00313  hypothetical protein  53.79 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3270  S-formylglutathione hydrolase  53.79 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103024  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0745  putative esterase  54.29 
 
 
280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  55.36 
 
 
281 aa  324  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  54.68 
 
 
283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0242  S-formylglutathione hydrolase  49.46 
 
 
277 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  53.99 
 
 
276 aa  305  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0170  S-formylglutathione hydrolase  48.39 
 
 
277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  55.97 
 
 
281 aa  301  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3448  carboxylesterase  53.57 
 
 
281 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  52.14 
 
 
283 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  53.21 
 
 
285 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2511  carboxylesterase  53.41 
 
 
276 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.863748  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0852  S-formylglutathione hydrolase  53.05 
 
 
276 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0052  carboxylesterase  54.87 
 
 
277 aa  298  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3123  carboxylesterase  52.71 
 
 
276 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  53.24 
 
 
279 aa  295  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  53.09 
 
 
282 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  51.07 
 
 
282 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0269  S-formylglutathione hydrolase  53.94 
 
 
251 aa  292  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  50 
 
 
281 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>