155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2442 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  85.77 
 
 
492 aa  850  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  99.41 
 
 
510 aa  1008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  100 
 
 
510 aa  1013  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  85.37 
 
 
492 aa  848  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  85.77 
 
 
492 aa  850  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  99.4 
 
 
503 aa  992  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  85.37 
 
 
492 aa  848  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  99.61 
 
 
510 aa  1009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90639e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  100 
 
 
510 aa  1013  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  85.77 
 
 
492 aa  853  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  85.57 
 
 
492 aa  850  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  85.37 
 
 
492 aa  854  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  85.57 
 
 
492 aa  850  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  85.77 
 
 
492 aa  850  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.61996e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  34.37 
 
 
483 aa  280  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  28.51 
 
 
493 aa  256  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
477 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  1.36517e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
476 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.39542e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 
497 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
504 aa  142  1e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.37 
 
 
504 aa  142  1e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 
484 aa  142  2e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  26.08 
 
 
501 aa  137  3e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  25.2 
 
 
501 aa  136  1e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 
479 aa  132  1e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
509 aa  132  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  26.24 
 
 
488 aa  129  1e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
501 aa  129  2e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 
503 aa  127  4e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 
499 aa  127  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
507 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
487 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  23.9 
 
 
504 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
508 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  24.04 
 
 
497 aa  121  2e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
503 aa  120  5e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
510 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  22.98 
 
 
510 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  20.73 
 
 
483 aa  120  8e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
500 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
502 aa  118  2e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
475 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
484 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
483 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
500 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
502 aa  116  1e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.12 
 
 
483 aa  115  2e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
488 aa  115  2e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.51 
 
 
505 aa  115  2e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
503 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 
487 aa  114  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 
507 aa  113  7e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 
486 aa  113  8e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
493 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
493 aa  111  4e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
471 aa  110  8e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
514 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
487 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
520 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
490 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.5001e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
490 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 
472 aa  107  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  27.16 
 
 
502 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
480 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
507 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
482 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  23.84 
 
 
479 aa  101  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
498 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 
488 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.27 
 
 
474 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.27 
 
 
475 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
494 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 
515 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
575 aa  97.8  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 
424 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 
487 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 
482 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 
509 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.91 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
504 aa  94  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  22.55 
 
 
512 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 
508 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 
514 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 
498 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
467 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 
421 aa  90.5  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.98 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
484 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
497 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
492 aa  88.2  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
500 aa  86.3  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.27 
 
 
492 aa  85.1  3e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
494 aa  84.3  4e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  25.69 
 
 
508 aa  82.4  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 
482 aa  81.6  3e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
502 aa  80.5  6e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
510 aa  78.6  2e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 
490 aa  79  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>