More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2425 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  98.3 
 
 		 353 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  99.15 
 
 		 353 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28 
 
 		 353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.22 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  25 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  29.77 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  30.64 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.63 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 361 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  33.33 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.88 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 393 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  26.67 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.44 
 
 		 430 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 401 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.75 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 423 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  21.66 
 
 		 376 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 359 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 672 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  23.73 
 
 		 373 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 375 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  28.69 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 428 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 535 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.98 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 457 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>