More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2393 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  99.75 
 
 		 404 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  99.75 
 
 		 404 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  99.75 
 
 		 404 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  100 
 
 		 404 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  99.5 
 
 		 404 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  55.36 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  55.1 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  52.94 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  52.04 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  52.3 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  52.3 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  52.3 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  52.3 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  52.04 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  52.3 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  52.3 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  51.79 
 
 		 397 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  51.53 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  50.76 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  53.3 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  53.3 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  49.87 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  49.62 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  50.38 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  49.64 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  48.24 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  48.23 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  49.87 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  48.67 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  48.74 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  49.24 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  48.99 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  50.64 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  51.02 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  47.34 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  48.11 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  49.23 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  46.95 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  50.77 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  50.38 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  46.68 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  48.74 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  46.37 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  47.73 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  47.06 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  47.09 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  46.72 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  45.66 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.45 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  45.96 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  45.8 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  48.35 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  47.21 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  45.55 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46.7 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44.5 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  45.8 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  45.71 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  47.21 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43.83 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  46.58 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  45.75 
 
 		 406 aa  363  3e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  45.59 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  43.91 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  44.81 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  43.72 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  43.72 
 
 		 399 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  46.1 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  46.68 
 
 		 397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  44.7 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  44.91 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  44.44 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  44.61 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  46.82 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.89 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  44.81 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  42.78 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  46.94 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0431  acetate kinase  42.46 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  44.5 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  42.42 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  42.64 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  41.41 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  42.46 
 
 		 421 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  42.68 
 
 		 421 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  44.25 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  45.48 
 
 		 404 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  41.41 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  42.24 
 
 		 398 aa  334  1e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  45.48 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  44.81 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  45.48 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  41.92 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  43.97 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  43.97 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  41.67 
 
 		 421 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  43.97 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  43.22 
 
 		 772 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  44.22 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  43.97 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>