28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2281 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2155  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  80.62 
 
 		 129 aa  228  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4449  bacteriophage V crossover junction endodeoxyribonuclease  79.84 
 
 		 129 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00181578  unclonable  0.00000000115544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1175  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  40.16 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000177122  hitchhiker  0.000000000000201219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2799  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  41.94 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.629369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  40.98 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00142112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1435  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  41.46 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1764  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  41.46 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387819  hitchhiker  0.00606421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  38.71 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565025  hitchhiker  0.0000000001404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0300  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  39.34 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  43.7 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1159  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  39.84 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  44.07 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3154  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  41.53 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000295998  hitchhiker  0.0000000000179448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1845  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  41.53 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000255271  hitchhiker  0.00000000107565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  41.18 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1260  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.68 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000987444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  40.34 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1441  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  46.39 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  40.34 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1523  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  41.98 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3595  endodeoxyribonuclease RusA  42.65 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1129  endodeoxyribonuclease RusA  36.27 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2324  endodeoxyribonuclease RusA  29.37 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0872  endodeoxyribonuclease RusA  33.85 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  26.32 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2442  hypothetical protein  29.25 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  30.17 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>