24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2279 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2279  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00859838  hitchhiker  4.1808499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2477  hypothetical protein  97.89 
 
 		 331 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0132225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4451  hypothetical protein  85.71 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000182249  unclonable  0.00000000157695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2153  hypothetical protein  85.11 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000696662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2614  hypothetical protein  61.7 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4112  decreased coverage  0.00553167 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2083  protein of unknown function DUF1277  53.58 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000880511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2076  hypothetical protein  53.58 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1767  hypothetical protein  53.58 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000332816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  51 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000639622  hitchhiker  0.000000000128788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  51 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  50.43 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  0.000000000247351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  50.86 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000197181  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  50.43 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1434  hypothetical protein  50.43 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000482166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  50.14 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000300414  hitchhiker  0.0000000000395416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  50.14 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000141733  hitchhiker  0.0000000024539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  50.14 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2253  hypothetical protein  51.03 
 
 		 339 aa  341  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215699  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1440  hypothetical protein  45.53 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1174  hypothetical protein  45.53 
 
 		 351 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000255184  hitchhiker  0.000000000000402769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1266  hypothetical protein  44.67 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00314635  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01529  predicted protein  64.13 
 
 		 192 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.271996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01963  hypothetical protein  31.72 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1003  hypothetical protein  44.3 
 
 		 168 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.787679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>