152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2269 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  99.03 
 
 
413 aa  859  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
413 aa  866  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  99.27 
 
 
413 aa  860  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2495  phage portal protein, HK97 family  97.14 
 
 
157 aa  285  1e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0490776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  40.16 
 
 
419 aa  275  1e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  37.7 
 
 
444 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  40.1 
 
 
420 aa  269  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  39.42 
 
 
409 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  39.01 
 
 
414 aa  262  9e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  38.74 
 
 
414 aa  260  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  38.54 
 
 
440 aa  255  1e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  36.54 
 
 
408 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  36.07 
 
 
424 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  37.08 
 
 
416 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  37.06 
 
 
421 aa  243  6e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  33.68 
 
 
417 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  33.59 
 
 
524 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  34.9 
 
 
431 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  34.9 
 
 
444 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  33.94 
 
 
417 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  33.79 
 
 
390 aa  222  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  36.78 
 
 
389 aa  217  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  34.25 
 
 
434 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  31.89 
 
 
426 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  34.92 
 
 
407 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  32.79 
 
 
423 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  33.25 
 
 
434 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  32.8 
 
 
384 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  32.2 
 
 
416 aa  201  1e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  31.63 
 
 
407 aa  202  1e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  32.2 
 
 
416 aa  201  1e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  30.48 
 
 
429 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  32.96 
 
 
412 aa  198  1e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  32.78 
 
 
404 aa  197  4e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  33.33 
 
 
420 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  31.96 
 
 
425 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  31.96 
 
 
425 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  31.96 
 
 
425 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  31.43 
 
 
428 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  30.85 
 
 
432 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  32.96 
 
 
460 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  32.05 
 
 
445 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  31.58 
 
 
436 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  32.96 
 
 
429 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  31.03 
 
 
434 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  30.19 
 
 
409 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  33.09 
 
 
473 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  30.08 
 
 
420 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  30.02 
 
 
415 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  31.25 
 
 
434 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  30.1 
 
 
412 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  30.99 
 
 
411 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  31.62 
 
 
401 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  31.48 
 
 
408 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  33.05 
 
 
414 aa  167  3e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  27.47 
 
 
408 aa  165  2e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  31 
 
 
404 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  30.07 
 
 
393 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  32 
 
 
542 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  30.14 
 
 
398 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  29.4 
 
 
416 aa  152  9e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  28.17 
 
 
392 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  29.25 
 
 
411 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  28.84 
 
 
445 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  28.87 
 
 
428 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  27.51 
 
 
445 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  27.94 
 
 
413 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  29.72 
 
 
397 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  24.35 
 
 
544 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  26.81 
 
 
464 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  28.97 
 
 
408 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  28.13 
 
 
395 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  26.55 
 
 
413 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  28.64 
 
 
406 aa  133  4e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  27.14 
 
 
417 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  27.4 
 
 
435 aa  129  8e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.65 
 
 
406 aa  128  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.26 
 
 
436 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.26 
 
 
436 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  26.4 
 
 
407 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  26.07 
 
 
433 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6128e-12 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  26.03 
 
 
447 aa  123  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.89 
 
 
455 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  37.07 
 
 
225 aa  121  2e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.65 
 
 
457 aa  120  4e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  26.42 
 
 
448 aa  116  8e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
437 aa  115  1e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.87 
 
 
455 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  28.48 
 
 
441 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  24.38 
 
 
422 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  24.11 
 
 
833 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  24.11 
 
 
833 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  24.11 
 
 
859 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  31.1 
 
 
391 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  24.52 
 
 
408 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  23.93 
 
 
404 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  23.93 
 
 
389 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  24.37 
 
 
397 aa  104  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  28.4 
 
 
399 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 
454 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>