46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2162 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1306  hypothetical protein  99.53 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123286  hitchhiker  0.000000111415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1321  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  hitchhiker  0.00000388777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2162  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000341487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1978  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1283  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1228  putative lipoprotein  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0969231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1227  putative lipoprotein  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000200273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01101  predicted outer membrane lipoprotein  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2496  membrane lipoprotein lipid attachment site  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000260622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2021  putative lipoprotein  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  hitchhiker  0.0000702236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2218  putative lipoprotein  88.68 
 
 		 212 aa  380  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1485  putative lipoprotein  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.757345  hitchhiker  0.0000742206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01109  hypothetical protein  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2542  membrane lipoprotein lipid attachment site  89.2 
 
 		 213 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00786128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1620  fibronectin-binding protein B  80.47 
 
 		 216 aa  352  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0791942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1635  membrane lipoprotein lipid attachment site  48.8 
 
 		 197 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00120258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2490  membrane lipoprotein lipid attachment site  50.48 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2796  membrane lipoprotein lipid attachment site  50.72 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1604  membrane lipoprotein lipid attachment site  47.87 
 
 		 197 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1922  membrane lipoprotein lipid attachment site  50.49 
 
 		 195 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.939521  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1590  putative lipoprotein  58.22 
 
 		 191 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228931  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1698  membrane lipoprotein lipid attachment site  58.22 
 
 		 191 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2816  putative lipoprotein  58.22 
 
 		 191 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0427  hypothetical protein  37.14 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.13 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.37 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.13 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.13 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.57 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  29.17 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  30 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.07 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  27.73 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  27.73 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  26.89 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  26.89 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.53 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.05 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  23.53 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.53 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>