52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1417 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  100 
 
 		 110 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  100 
 
 		 110 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  99.09 
 
 		 110 aa  229  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  61.47 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  58.33 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  58.33 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  61.47 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  59.63 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  59.63 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  59.63 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  59.63 
 
 		 109 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  59.63 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  58.72 
 
 		 109 aa  143  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  58.72 
 
 		 109 aa  143  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  59.63 
 
 		 109 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  57.8 
 
 		 109 aa  139  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  57.8 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  57.8 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  46.73 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  46.36 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  45.45 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  45.45 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  45.45 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  44.55 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  41.23 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  33.03 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  36.19 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  32.11 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  36.94 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  36.28 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  36.28 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  39.47 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  40.74 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  32.41 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  30.43 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  32.46 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2779  Phage minor tail  31.82 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00996028  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  32.46 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  34.18 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  30.26 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4061  minor tail family protein  35.16 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5051  minor tail family protein  35.16 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  29.27 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  29.41 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  31.86 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3531  minor tail family protein  34.07 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3100  minor tail family protein  30.43 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.033574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3878  minor tail family protein  34.07 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5754  minor tail family protein  34.07 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6226  minor tail family protein  29.29 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2201  phage minor tail protein  31.65 
 
 		 113 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7020  minor tail family protein  29.7 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>