More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1348 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  99.59 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  98.37 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  98.37 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  91.87 
 
 		 246 aa  467  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  88.66 
 
 		 247 aa  457  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  87.04 
 
 		 247 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  86.64 
 
 		 247 aa  447  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  86.23 
 
 		 247 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  85.02 
 
 		 247 aa  440  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  85.02 
 
 		 247 aa  440  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  84.62 
 
 		 247 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  84.62 
 
 		 247 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  74.8 
 
 		 246 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  74.9 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  73.68 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  71.95 
 
 		 247 aa  370  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  71.26 
 
 		 248 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  70.04 
 
 		 248 aa  362  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  70.04 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  70.04 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  70.04 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  70.04 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  69.64 
 
 		 248 aa  358  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  68.83 
 
 		 248 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  68.42 
 
 		 248 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  68.02 
 
 		 248 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  68.02 
 
 		 248 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  67.61 
 
 		 248 aa  349  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  67.61 
 
 		 250 aa  349  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  65.99 
 
 		 248 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  69.23 
 
 		 248 aa  338  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  67.21 
 
 		 248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  66.8 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  66.4 
 
 		 248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  66.94 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  65.99 
 
 		 248 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  64.78 
 
 		 248 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  62.35 
 
 		 248 aa  318  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  63.71 
 
 		 249 aa  318  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  63.97 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  63.97 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  63.56 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  62.1 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  60.49 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  60.49 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  59.51 
 
 		 248 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  61.69 
 
 		 249 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  59.18 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  58.06 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  63.56 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  57.92 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  55.28 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  62.14 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  58.55 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  59.11 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  59.11 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  55.47 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  55.06 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  57.26 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  54.55 
 
 		 247 aa  274  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  56.49 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  54.13 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  59.92 
 
 		 242 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  57.74 
 
 		 239 aa  271  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  57.74 
 
 		 239 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  59.5 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  56.9 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  54.13 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  58.68 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  58.68 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  59.09 
 
 		 242 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  54.17 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  54.13 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  59.09 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  58.05 
 
 		 239 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  54.96 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.89 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  58.68 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  58.68 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  58.68 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  54.66 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  58.09 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>