More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1324 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  93.41 
 
 		 167 aa  313  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  92.22 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  91.62 
 
 		 167 aa  303  6e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  87.5 
 
 		 165 aa  286  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  87.5 
 
 		 165 aa  286  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  87.5 
 
 		 165 aa  285  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  86.88 
 
 		 165 aa  285  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  84.24 
 
 		 166 aa  282  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  82.93 
 
 		 165 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  82.93 
 
 		 165 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  84.38 
 
 		 165 aa  274  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  74.5 
 
 		 174 aa  228  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  73.15 
 
 		 171 aa  225  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  73.15 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  73.15 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  73.15 
 
 		 171 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  73.15 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  73.15 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  73.15 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  73.15 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  73.15 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  73.15 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  73.15 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  73.15 
 
 		 175 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  73.15 
 
 		 171 aa  223  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  72.48 
 
 		 175 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  72.48 
 
 		 178 aa  222  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  72.97 
 
 		 178 aa  221  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  65.62 
 
 		 164 aa  220  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  73.29 
 
 		 175 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  65.85 
 
 		 164 aa  217  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  66.25 
 
 		 164 aa  217  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  70.39 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  67.74 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  67.74 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  64.71 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  66.03 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  67.35 
 
 		 156 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  64.94 
 
 		 171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  64.9 
 
 		 174 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  64.24 
 
 		 174 aa  197  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  62.82 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  64.63 
 
 		 169 aa  194  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  65.49 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  61.33 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  61.22 
 
 		 166 aa  187  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  59.12 
 
 		 174 aa  187  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02230  putative purine-binding chemotaxis protein  66.67 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  59.38 
 
 		 166 aa  184  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0257  putative purine-binding chemotaxis protein  66 
 
 		 161 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  61.54 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  61.54 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  59.44 
 
 		 170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  59.44 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  59.44 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  57.62 
 
 		 183 aa  180  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  59.44 
 
 		 165 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  60.56 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  60.13 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  57.32 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  55.28 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  55.28 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  55.28 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  55.28 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  55.28 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  55.28 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.32 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  58.74 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  58.74 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  58.74 
 
 		 170 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  59.46 
 
 		 158 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  57.24 
 
 		 160 aa  176  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  58.6 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  57.14 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  55.84 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  60.14 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  56.95 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  58.78 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24350  Chemotaxis protein  64.81 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  52.73 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  52.73 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  54.17 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  44.24 
 
 		 205 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0157  chemotaxis protein CheW  58.78 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0205  chemotaxis signal transduction protein  56.76 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  45.27 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  43.67 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  43.27 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>