More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1285 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  100 
 
 
505 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  98.02 
 
 
505 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  54.68 
 
 
502 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  67.66 
 
 
585 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  77.07 
 
 
568 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  82.78 
 
 
545 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  84.18 
 
 
579 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  78.92 
 
 
506 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  83.43 
 
 
498 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  76.59 
 
 
493 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  84.57 
 
 
506 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  84.57 
 
 
506 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  84.57 
 
 
506 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  66.24 
 
 
373 aa  289  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  83.91 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  83.91 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  80.45 
 
 
412 aa  283  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  75.81 
 
 
349 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  78.65 
 
 
422 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  39.49 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  70.92 
 
 
398 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  38.02 
 
 
475 aa  263  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  38.35 
 
 
475 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  69.7 
 
 
379 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  71.84 
 
 
567 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  74.59 
 
 
412 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2023  flagellin  85.26 
 
 
160 aa  258  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  36.94 
 
 
497 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  37.18 
 
 
493 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  37.57 
 
 
492 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  65.73 
 
 
356 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  35.95 
 
 
494 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  37.06 
 
 
486 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  34.25 
 
 
498 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  67.5 
 
 
288 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  43.79 
 
 
395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  66.88 
 
 
278 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  51.48 
 
 
392 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  59.63 
 
 
609 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  60.87 
 
 
405 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  61.88 
 
 
388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  59.41 
 
 
488 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  62.42 
 
 
275 aa  178  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  61.39 
 
 
492 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  58.49 
 
 
404 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  59.24 
 
 
501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  59.12 
 
 
431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  54.29 
 
 
276 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  57.86 
 
 
437 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  59.24 
 
 
490 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  60.13 
 
 
492 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  48.15 
 
 
271 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  48.15 
 
 
271 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  57.14 
 
 
472 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  55.97 
 
 
404 aa  166  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  59.33 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  56.05 
 
 
469 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  57.32 
 
 
492 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  52.2 
 
 
394 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  54.55 
 
 
375 aa  163  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  51.41 
 
 
273 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  47.69 
 
 
271 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  47.69 
 
 
271 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  48.45 
 
 
272 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  48.45 
 
 
272 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  50.59 
 
 
580 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  53.8 
 
 
481 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  51.65 
 
 
393 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  43.13 
 
 
271 aa  160  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  54.91 
 
 
272 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  52.94 
 
 
482 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  43.13 
 
 
271 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  56.86 
 
 
390 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  56.86 
 
 
390 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  48.65 
 
 
387 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  42.65 
 
 
271 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  48.88 
 
 
319 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  50 
 
 
420 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  42.18 
 
 
271 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  50.9 
 
 
275 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  53.75 
 
 
294 aa  156  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  51.12 
 
 
270 aa  156  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  45.13 
 
 
273 aa  156  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  52.2 
 
 
383 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  51.46 
 
 
484 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  52.69 
 
 
279 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  50.57 
 
 
271 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  49.72 
 
 
272 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  40.76 
 
 
384 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  40.76 
 
 
384 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  50.57 
 
 
271 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  49.72 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  49.41 
 
 
488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  52.41 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  44.65 
 
 
273 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  51.45 
 
 
272 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  48.28 
 
 
492 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.25 
 
 
280 aa  154  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  43.88 
 
 
271 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  43.88 
 
 
271 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>