106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1264 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  70.16 
 
 
124 aa  167  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1237  flagellar biosynthesis protein FliO  67.2 
 
 
121 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0462666  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1695  flagellar biosynthesis protein FliO  66.94 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18935  normal  0.0258842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2047  flagellar biosynthesis protein FliO  66.94 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1068  flagellar biosynthesis protein FliO  66.94 
 
 
121 aa  106  8e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.4308e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1701  flagellar biosynthesis protein FliO  68 
 
 
121 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2180  flagellar biosynthesis protein FliO  67.2 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.96305e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  45 
 
 
140 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  47.71 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2724  flagellar biosynthesis protein FliO  68.18 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0658443  normal  0.30284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  42.96 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  42.96 
 
 
178 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  44.07 
 
 
139 aa  81.3  5e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2956  flagellar biosynthesis protein FliO  50 
 
 
140 aa  75.1  3e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  42.86 
 
 
138 aa  73.2  1e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  45.74 
 
 
186 aa  71.2  4e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  41 
 
 
149 aa  69.7  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  37.39 
 
 
127 aa  68.6  3e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  37.39 
 
 
127 aa  68.6  3e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  46.74 
 
 
130 aa  68.2  4e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  43.04 
 
 
124 aa  68.2  4e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.82 
 
 
133 aa  67  9e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  44.86 
 
 
140 aa  66.2  2e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  41.18 
 
 
163 aa  65.1  3e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  40 
 
 
125 aa  63.9  8e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  37.27 
 
 
209 aa  62.4  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  42.68 
 
 
224 aa  61.2  4e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.52 
 
 
187 aa  61.2  4e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.17 
 
 
188 aa  60.8  5e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.13 
 
 
149 aa  60.8  6e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  34.62 
 
 
127 aa  60.5  7e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1094  flagellar protein FliO  37.14 
 
 
112 aa  59.7  1e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140384  normal  0.933798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  46.38 
 
 
180 aa  59.7  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  33.04 
 
 
159 aa  58.9  2e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  44.93 
 
 
186 aa  58.9  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  42.25 
 
 
136 aa  58.5  3e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  36.67 
 
 
203 aa  58.5  3e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  36.67 
 
 
206 aa  58.5  3e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  39.76 
 
 
120 aa  57.8  5e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  45.59 
 
 
193 aa  57.4  6e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  45.59 
 
 
193 aa  57.4  6e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1871  flagellar biosynthesis protein FliO  45.68 
 
 
139 aa  57.4  7e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.577074  normal  0.501189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  43.48 
 
 
191 aa  57.4  7e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3584  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  34.38 
 
 
168 aa  56.6  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.621138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.55 
 
 
125 aa  55.5  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  28.45 
 
 
136 aa  55.8  2e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.58 
 
 
221 aa  55.1  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  40.58 
 
 
211 aa  55.1  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  45.56 
 
 
152 aa  55.5  3e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  40.58 
 
 
221 aa  55.1  3e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  40.58 
 
 
164 aa  55.1  3e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.5 
 
 
143 aa  55.1  3e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  40.58 
 
 
221 aa  55.1  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  39.13 
 
 
211 aa  55.1  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  40.58 
 
 
221 aa  55.1  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00972  flagellar protein  49.18 
 
 
138 aa  54.7  4e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0238989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.33 
 
 
146 aa  55.1  4e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06194  flagellar protein  49.18 
 
 
138 aa  54.7  4e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  30.43 
 
 
137 aa  53.9  7e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  37.21 
 
 
208 aa  53.9  7e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  35.05 
 
 
150 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  35 
 
 
146 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  28.7 
 
 
136 aa  52.4  2e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  35.92 
 
 
151 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  36.63 
 
 
124 aa  52.4  2e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  29.82 
 
 
137 aa  52.4  2e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  32.04 
 
 
144 aa  50.8  5e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.89 
 
 
163 aa  50.8  6e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  30.28 
 
 
129 aa  50.8  7e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0647  flagellar biosynthesis protein FliO  37.74 
 
 
111 aa  50.4  7e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  32.99 
 
 
151 aa  50.8  7e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.47 
 
 
166 aa  50.1  1e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1025  flagellar biosynthesis protein FliO  45.95 
 
 
140 aa  49.3  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4386  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.36 
 
 
121 aa  49.3  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.94 
 
 
145 aa  47.4  7e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.49 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1609  flagellar biogenesis protein FliO  49.41 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796817  normal  0.163037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2732  flagellar biosynthesis protein FliO  38.27 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1291  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.6 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.6 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1358  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.6 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  38.6 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  29.51 
 
 
211 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  34.33 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0574  flagellar biogenesis protein  41.1 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  37.14 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  32.04 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  36.84 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.78 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3072  flagellar biosynthesis protein FliO  40.62 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  36.84 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3798  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.62 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  36.84 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1123  hypothetical protein  50.94 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  27.94 
 
 
120 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>