26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1228 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  98.55 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  68.12 
 
 		 137 aa  200  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  68.12 
 
 		 137 aa  200  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  67.39 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.59 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.84 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.09 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.33 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  30.83 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.33 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  30.5 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  30.53 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  28.24 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  29.01 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  29.01 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.88 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  25 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  33.09 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  34.38 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  32.35 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  33.9 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  29.1 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>