140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1226 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  99.17 
 
 		 362 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  80.61 
 
 		 360 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  80.33 
 
 		 360 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  80.06 
 
 		 360 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  54.4 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  57.23 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  50.14 
 
 		 337 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  50.43 
 
 		 332 aa  319  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  49.57 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  43.2 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  41.74 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  42.51 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  41.39 
 
 		 337 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  42.58 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  37.46 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  36.71 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  36.42 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  35.84 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  36.21 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  37.07 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  36.93 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  35.67 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  36.73 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  34.77 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  34.75 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  34.23 
 
 		 309 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  33.21 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  30.6 
 
 		 329 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  30.89 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  30.89 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  30.77 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  30.58 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  37.31 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  27.44 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  27.36 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  30.65 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  29.43 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  27.44 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  27.13 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  26.52 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  27.41 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  29.58 
 
 		 388 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.35 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  29.97 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.4 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.11 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  25.46 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  27.02 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  26.21 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  27.02 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.69 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  28.62 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  26.01 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  23.89 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.89 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.95 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  26.37 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  27.11 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  24.69 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  27.11 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  25.64 
 
 		 336 aa  86.3  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  26.01 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  25.66 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  27.48 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  24.55 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  26.59 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  25.78 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  25.5 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  24.27 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  24.27 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  24.27 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  25.83 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  23.75 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  24.16 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  23.67 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  24.83 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  25.17 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  25.17 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  24.27 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  25.17 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  26.38 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  25.16 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  24.64 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  25.16 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  24.64 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  25.25 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  24.64 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  25.16 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  25.16 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  25.16 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  24.64 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  25.16 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  24.18 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  25.61 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  24.18 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  24.18 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>