More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1184 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  99.68 
 
 		 312 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  99.68 
 
 		 312 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  99.68 
 
 		 312 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  99.68 
 
 		 312 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  45.42 
 
 		 314 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  40.21 
 
 		 283 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  39.12 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  36.74 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  41.49 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  35.92 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  33.62 
 
 		 414 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  33 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  35.52 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  32.2 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  30.03 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  34.71 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  34.1 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  27.54 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  28.17 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.47 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  28.24 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  28.88 
 
 		 381 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.9 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  27.02 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  28.87 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  28.87 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  28.87 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  27.78 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  25.3 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  25.3 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.4 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.85 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  28.19 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.5 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.67 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  24.59 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  29.77 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.67 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  27.3 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  37.89 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.28 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.16 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  26.98 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.58 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.35 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  25.91 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.98 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.37 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.18 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  24.51 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  23.6 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.83 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  26.12 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  23.28 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  25.94 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  27.18 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  26.87 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  23.55 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.22 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  23.97 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  23.92 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.94 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  21.93 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>