More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1143 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00959  predicted peptidase  85.67 
 
 
586 aa  1035  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.59682e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1131  protease La homolog  99.49 
 
 
586 aa  1195  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.0712e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1119  peptidase, S16 (lon protease) family  85.84 
 
 
586 aa  1038  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.03379e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  57.8 
 
 
583 aa  694  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1026  lon protease (S16) proteolytic domain protein  99.83 
 
 
586 aa  1199  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.3789e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1064  S16 family peptidase  85.67 
 
 
586 aa  1037  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20941e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1467  putative ATP-dependent protease  74.23 
 
 
586 aa  921  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.04055e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1143  lon protease (S16) proteolytic domain-containing protein  100 
 
 
586 aa  1200  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0143883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1109  putative Putative protease La homolog  100 
 
 
586 aa  1200  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000428257  hitchhiker  0.00783393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1177  protease La-like protein  99.83 
 
 
586 aa  1198  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00123977  normal  0.54103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  53.63 
 
 
589 aa  639  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1598  hypothetical protein  53.54 
 
 
576 aa  636  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  9.47515e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  56.43 
 
 
590 aa  677  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.64824e-07  decreased coverage  6.03795e-07 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2688  putative ATP-dependent protease  85.67 
 
 
586 aa  1037  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.56121e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2641  peptidase S16 lon domain-containing protein  85.67 
 
 
586 aa  1037  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.12327e-07  hitchhiker  6.06295e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  60.19 
 
 
540 aa  669  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  5.10666e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2165  S16 family peptidase  86.01 
 
 
586 aa  1038  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.28937e-07  normal  0.352298 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  57.8 
 
 
583 aa  694  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.94909e-10  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1069  S16 family peptidase  85.84 
 
 
586 aa  1038  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.6445e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00966  hypothetical protein  85.67 
 
 
586 aa  1035  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  5.57522e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2361  peptidase, S16 (lon protease) family  85.67 
 
 
586 aa  1035  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.51656e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  52.94 
 
 
589 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  7.2938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  53.11 
 
 
575 aa  628  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0411  hypothetical protein  48.29 
 
 
584 aa  565  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.775698  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  39.79 
 
 
598 aa  407  1e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0858  ATP-dependent Lon protease  40.8 
 
 
603 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  8.38018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  37.39 
 
 
546 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.34026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  36.06 
 
 
546 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1557  putative protease La homolog  41.52 
 
 
555 aa  357  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00224903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  40.73 
 
 
844 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  36.78 
 
 
777 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  34.46 
 
 
786 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.53 
 
 
816 aa  284  3e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.95 
 
 
800 aa  283  4e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.51631e-05  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.18 
 
 
810 aa  283  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  38.93 
 
 
803 aa  283  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  38.41 
 
 
807 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  36.68 
 
 
810 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  35.8 
 
 
786 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  38.01 
 
 
791 aa  279  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.64 
 
 
805 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  38.37 
 
 
805 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  38.35 
 
 
799 aa  277  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.25 
 
 
802 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  35.42 
 
 
786 aa  277  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  38.64 
 
 
805 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.64 
 
 
805 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  38.35 
 
 
805 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.35 
 
 
805 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.77 
 
 
805 aa  275  2e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  38.13 
 
 
806 aa  274  4e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  38.81 
 
 
811 aa  272  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  37.62 
 
 
809 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  37.65 
 
 
951 aa  272  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.94 
 
 
795 aa  271  3e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  37.65 
 
 
975 aa  270  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.4 
 
 
801 aa  267  3e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  36.17 
 
 
660 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  35.71 
 
 
797 aa  266  6e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  40.27 
 
 
806 aa  266  6e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  37.41 
 
 
808 aa  264  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  38.53 
 
 
809 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  37.64 
 
 
832 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  35.48 
 
 
802 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  37.1 
 
 
819 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  37.2 
 
 
814 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  37.92 
 
 
810 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.21 
 
 
788 aa  258  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.82 
 
 
805 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  38.92 
 
 
806 aa  256  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  37.38 
 
 
803 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  36.08 
 
 
813 aa  254  4e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.65 
 
 
813 aa  253  5e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  36.4 
 
 
812 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  36.23 
 
 
795 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.29 
 
 
812 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  33.8 
 
 
786 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  37.14 
 
 
861 aa  250  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  37.8 
 
 
812 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  37.8 
 
 
812 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  37.1 
 
 
815 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  35.84 
 
 
829 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.80038e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.59 
 
 
806 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  35.62 
 
 
814 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  37.32 
 
 
812 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.56 
 
 
805 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  35.65 
 
 
817 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  35.65 
 
 
817 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  36.83 
 
 
811 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  36.1 
 
 
811 aa  247  5e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  37.76 
 
 
599 aa  246  1e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.27268e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.07 
 
 
810 aa  245  2e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.69789e-05  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  34.05 
 
 
821 aa  243  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  35.06 
 
 
774 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.21 
 
 
843 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  33.87 
 
 
798 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  33.81 
 
 
811 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.35674e-05  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  34.96 
 
 
829 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  34.27 
 
 
819 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  35.09 
 
 
577 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>