146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0704 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  99.19 
 
 
268 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  99.19 
 
 
268 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  98.39 
 
 
248 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  98.79 
 
 
248 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.08 
 
 
268 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.95 
 
 
253 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.95 
 
 
248 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.95 
 
 
248 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  80.95 
 
 
247 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.95 
 
 
248 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.95 
 
 
248 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  80.95 
 
 
248 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  66.96 
 
 
251 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  49.13 
 
 
256 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  49.57 
 
 
256 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  51.85 
 
 
253 aa  255  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  90.91 
 
 
141 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.19 
 
 
257 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.26 
 
 
252 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.65 
 
 
252 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.12 
 
 
249 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.78 
 
 
252 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.71 
 
 
254 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  38.04 
 
 
276 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  38.04 
 
 
286 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.32 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.09 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  39.3 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  69.64 
 
 
122 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.64 
 
 
257 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  35.96 
 
 
268 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  40.65 
 
 
333 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  30.83 
 
 
272 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  29.73 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.49 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  29.49 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  29.3 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  29.3 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  28.57 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  32.73 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  30.43 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  27.41 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  30.19 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  30.19 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.74 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  25.71 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  22.99 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.74 
 
 
178 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  30.48 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  28.74 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  31.36 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  31.36 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  28.15 
 
 
399 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  23.78 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  24.72 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.84 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.84 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 
201 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.84 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.75 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.84 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.84 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  29.78 
 
 
236 aa  52  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  29.81 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  29.81 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.78 
 
 
236 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  29.81 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.78 
 
 
236 aa  52  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  29.81 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.78 
 
 
236 aa  52  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  29.81 
 
 
242 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.78 
 
 
236 aa  52  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  29.78 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  29.78 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.78 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  26.18 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  23.26 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.8 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  28.28 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  26.92 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  27.4 
 
 
533 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  24.28 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  22.67 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  28.32 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  27.88 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  24.28 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.34 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  27.88 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.32 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.32 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  30.19 
 
 
231 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.32 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.32 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.32 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.32 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.32 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  28.18 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.03 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3850  hypothetical protein  23.31 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>