17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0612 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0612  gp49  100 
 
 		 235 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  54.6 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  47.49 
 
 		 170 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0373  recombination function protein  74.65 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  hitchhiker  0.00000000000741126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  42.65 
 
 		 167 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  43.44 
 
 		 179 aa  99.8  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  27.8 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  37.69 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  34.96 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  34.78 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  39.84 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  34.78 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  38.46 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  37.4 
 
 		 170 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  32.32 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  31.62 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>