More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0460 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  99.69 
 
 		 326 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 326 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  99.08 
 
 		 326 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 		 326 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  86.81 
 
 		 325 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  86.81 
 
 		 325 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  87.12 
 
 		 325 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  86.81 
 
 		 325 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  87.12 
 
 		 325 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  86.81 
 
 		 325 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  86.81 
 
 		 325 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  86.5 
 
 		 325 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  86.81 
 
 		 325 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  83.13 
 
 		 325 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  81.48 
 
 		 323 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  74.61 
 
 		 324 aa  484  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  72.84 
 
 		 327 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  72.31 
 
 		 329 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  72 
 
 		 329 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  73.68 
 
 		 324 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  72 
 
 		 329 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  71.91 
 
 		 326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  71.6 
 
 		 326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  61.3 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  60.5 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  57.37 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  57.05 
 
 		 323 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  57.05 
 
 		 323 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  57.05 
 
 		 323 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  57.05 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  56.43 
 
 		 318 aa  358  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  56.11 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  56.11 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  55.94 
 
 		 319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  55.8 
 
 		 318 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  58.31 
 
 		 318 aa  348  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  57.41 
 
 		 333 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  54.37 
 
 		 321 aa  344  8.999999999999999e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  55.62 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  54.86 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  56.25 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  54.15 
 
 		 334 aa  339  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  55.59 
 
 		 321 aa  338  7e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  55.14 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  53.57 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  51.72 
 
 		 336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  50.31 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  48.92 
 
 		 330 aa  298  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  47.65 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  49.39 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  48.48 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  45.1 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  47.2 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  47.24 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  47.49 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  45.79 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  47.26 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  45.1 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  41.72 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  41.72 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  50.93 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  48.69 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  51.48 
 
 		 318 aa  251  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  44.51 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  45.65 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  46.6 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  47.85 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  46.99 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  48.29 
 
 		 321 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  45.79 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  46.71 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  47.09 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  46.18 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  46.13 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  45.65 
 
 		 361 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  45.54 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  46.81 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  46.81 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  45.65 
 
 		 361 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  46.91 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  47.73 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  45.32 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  47.13 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  42.17 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0573  thiamine-monophosphate kinase  43.48 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.929555  normal  0.0493584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  47.43 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  47.43 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  44.55 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  44.55 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  45.48 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  44 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>