More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0354 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.61 
 
 		 417 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.89 
 
 		 417 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  85.61 
 
 		 417 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.89 
 
 		 417 aa  714    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.32 
 
 		 416 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.85 
 
 		 417 aa  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.1 
 
 		 417 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.32 
 
 		 416 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 415 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.41 
 
 		 417 aa  710    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.41 
 
 		 417 aa  710    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.56 
 
 		 416 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.89 
 
 		 417 aa  715    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.32 
 
 		 416 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  83.69 
 
 		 417 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.89 
 
 		 417 aa  713    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 		 417 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.36 
 
 		 417 aa  617  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.66 
 
 		 417 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.9 
 
 		 417 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.78 
 
 		 419 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.78 
 
 		 419 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.78 
 
 		 419 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.45 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.87 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.11 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.66 
 
 		 411 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.35 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.67 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.08 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.35 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.66 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 		 425 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.34 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 		 425 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 		 425 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 		 425 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.24 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.39 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.65 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.13 
 
 		 419 aa  418  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.28 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.02 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.71 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.09 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.35 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.51 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 418 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.8 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.06 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.58 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2279  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0615198  hitchhiker  0.00168342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.43 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.99 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.79 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.4 
 
 		 424 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.55 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.77 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.94 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.25 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.59 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.5 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.62 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  48 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.52 
 
 		 418 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.81 
 
 		 415 aa  381  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.54 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.42 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.97 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.98 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.27 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>