More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0303 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  99.54 
 
 		 434 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  99.77 
 
 		 434 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  99.54 
 
 		 434 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  55.12 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  55.12 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  55.12 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  55.21 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  54.07 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  55.96 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  48.69 
 
 		 415 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  46.52 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  45.32 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  45.26 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  46.25 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  45.89 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  48.4 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  48.4 
 
 		 421 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  48.4 
 
 		 421 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  48.4 
 
 		 421 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  48.14 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  48.14 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  48.14 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  44.07 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  40.95 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  40.71 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  46.09 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  40.9 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  37.89 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  37.63 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  37.63 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  37.63 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  37.63 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  37.63 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  37.63 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  37.11 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  35.32 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  38.26 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  34.55 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.6 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  37.7 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  36.34 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  37.28 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  39.58 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  36.86 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  44.02 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  35.36 
 
 		 453 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  35.71 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.89 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  35.71 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  34.4 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  30.62 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  36.04 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  30.67 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 404 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  30.45 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.84 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  35.27 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  30.77 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  35.68 
 
 		 308 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  38.42 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  35.09 
 
 		 289 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  35.09 
 
 		 289 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  29.74 
 
 		 536 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  28.97 
 
 		 536 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  34.29 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  29.04 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  28.57 
 
 		 487 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.59 
 
 		 327 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  32.89 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  29.32 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  27.98 
 
 		 571 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.98 
 
 		 552 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.98 
 
 		 552 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  28.18 
 
 		 571 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  28.18 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  28.18 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  28.11 
 
 		 511 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  37.34 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  33.2 
 
 		 271 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2876  DotU family type IV/VI secretion system protein  38.1 
 
 		 201 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  27.6 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  34.63 
 
 		 273 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  27.78 
 
 		 289 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.09 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  30.95 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  30.29 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  33.73 
 
 		 310 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  32.35 
 
 		 282 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  29.91 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  32.35 
 
 		 282 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  30.26 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  36.05 
 
 		 263 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  35.37 
 
 		 263 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  31.64 
 
 		 258 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.8 
 
 		 258 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  27.01 
 
 		 290 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>