More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0188 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  94.14 
 
 		 256 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  93.36 
 
 		 256 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  91.02 
 
 		 256 aa  447  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  86.33 
 
 		 256 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  84.77 
 
 		 256 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  83.2 
 
 		 256 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  80.08 
 
 		 256 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  80.08 
 
 		 256 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  80.08 
 
 		 256 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1157  ABC-2 type transporter  83.59 
 
 		 256 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0839963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2826  ABC-2 type transporter  82.03 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  69.92 
 
 		 256 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  70.31 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  69.53 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  69.57 
 
 		 254 aa  367  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  69.92 
 
 		 256 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 256 aa  363  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  69.53 
 
 		 258 aa  362  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  68.36 
 
 		 256 aa  362  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  69.53 
 
 		 256 aa  362  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 256 aa  360  9e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  68.92 
 
 		 271 aa  358  7e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  67.58 
 
 		 262 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  68.36 
 
 		 256 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  67.58 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  67.58 
 
 		 258 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  66.8 
 
 		 256 aa  352  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  68.13 
 
 		 254 aa  347  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  68.36 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2614  ABC transporter, integral membrane protein  71.48 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  64.29 
 
 		 260 aa  334  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  68.4 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  62.15 
 
 		 257 aa  328  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  60.87 
 
 		 257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  59.45 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  59.61 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  60 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  58.82 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  62.8 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  62.4 
 
 		 259 aa  315  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  60 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  59.2 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  59.6 
 
 		 259 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  59.61 
 
 		 260 aa  311  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  62.06 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  58.73 
 
 		 257 aa  308  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  58.82 
 
 		 259 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  58.8 
 
 		 262 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  59.22 
 
 		 259 aa  307  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  58.8 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  58 
 
 		 257 aa  301  7.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  58 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  57.09 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  59.2 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  56.69 
 
 		 263 aa  294  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  55.91 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  55.37 
 
 		 276 aa  281  9e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  52.4 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  54.44 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  54.44 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  52.4 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  49.6 
 
 		 257 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  49.6 
 
 		 257 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  47.62 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  43.82 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1658  ABC-2 type transporter  43.04 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  40.96 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  41.15 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  39.76 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  42.26 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  40.69 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  41.15 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>