More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0079 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  791  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  791  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  791  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  791  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  791  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  81.32 
 
 
377 aa  645  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  79.47 
 
 
378 aa  639  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  97.63 
 
 
380 aa  778  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  79.47 
 
 
378 aa  639  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  78.95 
 
 
378 aa  635  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.64 
 
 
383 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
383 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
383 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
383 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
383 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.43 
 
 
383 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
383 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  48.43 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
384 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
383 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
383 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.17 
 
 
383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.17 
 
 
383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.17 
 
 
383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.17 
 
 
383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.17 
 
 
383 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.89 
 
 
381 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.31 
 
 
383 aa  321  1e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
380 aa  321  1e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.2 
 
 
391 aa  312  6e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.95 
 
 
385 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  34.11 
 
 
385 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
383 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
384 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.98 
 
 
394 aa  198  1e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.09 
 
 
384 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 
380 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  31.84 
 
 
380 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.72 
 
 
380 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.65 
 
 
377 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.24 
 
 
380 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.94 
 
 
392 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30 
 
 
379 aa  185  1e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.45 
 
 
396 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.32 
 
 
379 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1399  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.23 
 
 
385 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.58 
 
 
383 aa  182  9e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1669  butyryl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
385 aa  182  9e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.260436  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.59 
 
 
397 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  31.32 
 
 
379 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.26 
 
 
379 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1527  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.97 
 
 
385 aa  180  3e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  180  3e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14865e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  180  3e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  29.82 
 
 
381 aa  180  3e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  180  3e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1491  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.97 
 
 
385 aa  180  3e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  180  3e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.96 
 
 
384 aa  180  3e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.97 
 
 
385 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.91 
 
 
375 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2854  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.97 
 
 
385 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.715109  hitchhiker  4.60252e-08 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.91 
 
 
405 aa  180  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.06 
 
 
383 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  179  5e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2769  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.85 
 
 
385 aa  179  5e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.329604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  180  5e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  180  5e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29924e-10 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1941  butyryl-CoA dehydrogenase  31.5 
 
 
385 aa  179  5e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  179  5e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.58 
 
 
388 aa  179  6e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  9.54759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.53 
 
 
385 aa  179  6e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  179  6e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  179  6e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  29.55 
 
 
381 aa  179  6e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.28 
 
 
383 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.74 
 
 
400 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.91 
 
 
375 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.55 
 
 
381 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  179  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.37 
 
 
381 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2595  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.85 
 
 
385 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  30.57 
 
 
388 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  8.36039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.85 
 
 
385 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.553599  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  30.45 
 
 
379 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  29.63 
 
 
376 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2781  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.21 
 
 
385 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  30.45 
 
 
379 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.08426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.98 
 
 
387 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>