26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0061 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0062  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0063  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  98.73 
 
 		 79 aa  153  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3713  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  96.15 
 
 		 80 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0060  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  98.68 
 
 		 79 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3545  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  91.03 
 
 		 80 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3544  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  92.31 
 
 		 80 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3651  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  95.45 
 
 		 80 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3616  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  94.87 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.384488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0830  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  77.94 
 
 		 68 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0802  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  76.92 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0893  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  71.88 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0861  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  73.85 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0201  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  52.05 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.41736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0692  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  44.74 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3624  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  48 
 
 		 83 aa  57  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194054  decreased coverage  0.0000000418029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0321  putative oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  36.9 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1305  ribonuclease D  39.51 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00021107  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1260  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase gamma subunit  39.47 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.406933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0970  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  44.74 
 
 		 83 aa  48.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002524  oxaloacetate decarboxylase gamma chain  36.71 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0628389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03492  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  36.71 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3195  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  38.46 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139992  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A0084  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.54 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000518126  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_1320  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  34.67 
 
 		 98 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219843  hitchhiker  0.0088654 
 
 
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