232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0042 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  93.51 
 
 
388 aa  675  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  93.51 
 
 
388 aa  675  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  93.25 
 
 
388 aa  674  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  93.51 
 
 
388 aa  675  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  93.51 
 
 
388 aa  675  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  93.51 
 
 
388 aa  675  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  93.51 
 
 
388 aa  675  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
388 aa  759  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
388 aa  759  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
388 aa  759  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
388 aa  759  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
388 aa  759  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  92.99 
 
 
388 aa  672  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  93.51 
 
 
388 aa  675  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  83.12 
 
 
391 aa  591  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.14 
 
 
398 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.1 
 
 
389 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.85 
 
 
394 aa  452  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.29218e-06  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.57 
 
 
394 aa  452  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.17181e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  66.57 
 
 
394 aa  452  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.05 
 
 
389 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.42 
 
 
394 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.05 
 
 
389 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.05 
 
 
389 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.05 
 
 
389 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.84 
 
 
391 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.62 
 
 
389 aa  447  1e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.79 
 
 
391 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.1 
 
 
392 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.1 
 
 
389 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.84 
 
 
389 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.64 
 
 
398 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.36 
 
 
398 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.4 
 
 
401 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.53 
 
 
391 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.53 
 
 
391 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  59.54 
 
 
383 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.58 
 
 
399 aa  416  1e-115  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.44 
 
 
390 aa  417  1e-115  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.38 
 
 
382 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.35639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.28 
 
 
391 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.48 
 
 
391 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.62 
 
 
398 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.03 
 
 
382 aa  406  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  54.69 
 
 
391 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  55.47 
 
 
396 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.47 
 
 
395 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.93238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  51.05 
 
 
386 aa  377  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.22 
 
 
395 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.88 
 
 
391 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.7 
 
 
409 aa  376  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.68 
 
 
397 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  51.62 
 
 
382 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.42 
 
 
397 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  53.33 
 
 
401 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  53.23 
 
 
393 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.27 
 
 
397 aa  362  5e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.23 
 
 
399 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.21 
 
 
397 aa  353  3e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.97 
 
 
392 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  51.04 
 
 
425 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  52.74 
 
 
392 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  48.7 
 
 
424 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.01 
 
 
400 aa  348  8e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.08 
 
 
399 aa  348  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  52.78 
 
 
399 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  47.91 
 
 
382 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  48.42 
 
 
394 aa  347  3e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  48.29 
 
 
382 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.72 
 
 
389 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.57 
 
 
399 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  48.29 
 
 
382 aa  344  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  51.45 
 
 
391 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.65 
 
 
400 aa  344  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.72 
 
 
389 aa  344  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.72 
 
 
389 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.08 
 
 
396 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.61 
 
 
400 aa  340  3e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  49.75 
 
 
423 aa  337  3e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 
398 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.78 
 
 
391 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  47.48 
 
 
408 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  46.74 
 
 
450 aa  329  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  51.3 
 
 
391 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  44.76 
 
 
455 aa  326  4e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  44.56 
 
 
396 aa  326  5e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  44.5 
 
 
395 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.62 
 
 
384 aa  323  5e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.06 
 
 
400 aa  320  2e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  45.81 
 
 
406 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.78 
 
 
393 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  50.26 
 
 
408 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.81 
 
 
407 aa  315  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  44.05 
 
 
455 aa  314  2e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  45.83 
 
 
379 aa  313  4e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  42.18 
 
 
452 aa  313  5e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  47.14 
 
 
402 aa  312  6e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.34714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  44.58 
 
 
464 aa  311  9e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  51.03 
 
 
424 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  43.05 
 
 
436 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>