More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0038 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  99.8 
 
 
497 aa  1024    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  99.6 
 
 
497 aa  1021    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  99.4 
 
 
497 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  100 
 
 
497 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  90.74 
 
 
497 aa  952    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  72.97 
 
 
501 aa  759    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  87.93 
 
 
497 aa  920    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  33.61 
 
 
452 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  32.33 
 
 
497 aa  220  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  32.57 
 
 
510 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  32.55 
 
 
470 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  32.48 
 
 
539 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.45 
 
 
468 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  32.16 
 
 
466 aa  202  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.74 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  29.26 
 
 
519 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.75 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  31.28 
 
 
491 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.06 
 
 
462 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  29.28 
 
 
479 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  30.35 
 
 
453 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  31.69 
 
 
458 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  31.47 
 
 
440 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.04 
 
 
523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.24 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.89 
 
 
440 aa  191  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  28.46 
 
 
484 aa  190  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  31.43 
 
 
500 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.16 
 
 
495 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  29.7 
 
 
472 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.24 
 
 
536 aa  187  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  28.15 
 
 
517 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.83 
 
 
486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  29.77 
 
 
492 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 
457 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  27.93 
 
 
500 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.24 
 
 
553 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  30.18 
 
 
471 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.81 
 
 
481 aa  183  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  31.4 
 
 
487 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  30.27 
 
 
631 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.59 
 
 
480 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  31 
 
 
543 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.8 
 
 
638 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.22 
 
 
488 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  30.77 
 
 
481 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  30.35 
 
 
506 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.28 
 
 
506 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  30.36 
 
 
480 aa  176  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  29.13 
 
 
507 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  31.95 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  30.16 
 
 
490 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  31.97 
 
 
457 aa  173  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  29.3 
 
 
467 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  30.32 
 
 
511 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  27.73 
 
 
627 aa  170  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.2 
 
 
543 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  26.92 
 
 
520 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  27.9 
 
 
609 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  28.24 
 
 
553 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  27.31 
 
 
520 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  27.82 
 
 
489 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  30.14 
 
 
500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  27.95 
 
 
503 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  28.2 
 
 
513 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  28.09 
 
 
541 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.36 
 
 
465 aa  166  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.24 
 
 
482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  28.62 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.51 
 
 
491 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  28.06 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  29.04 
 
 
497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.6 
 
 
548 aa  163  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  29.18 
 
 
483 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  29.64 
 
 
578 aa  163  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  27.37 
 
 
581 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  27.8 
 
 
493 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.03 
 
 
522 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  28.67 
 
 
480 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  28.05 
 
 
523 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  28.63 
 
 
442 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  27.22 
 
 
482 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  28.4 
 
 
517 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  28.21 
 
 
486 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  29.83 
 
 
453 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  27.56 
 
 
526 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  27.72 
 
 
523 aa  160  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  28.57 
 
 
551 aa  160  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  28.68 
 
 
596 aa  160  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  29.21 
 
 
512 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.72 
 
 
471 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.31 
 
 
478 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  29.57 
 
 
523 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  26.76 
 
 
535 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  29.94 
 
 
459 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.39 
 
 
470 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  26.76 
 
 
535 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  29.32 
 
 
489 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  26.96 
 
 
554 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  26.76 
 
 
535 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>