277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0028 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  99.53 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  98.58 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  97.63 
 
 		 243 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  96.68 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2175  putativi pili assembly chaperone  42.79 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.741204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1059  putativi pili assembly chaperone  42.79 
 
 		 245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00948  predicted periplasmic pilini chaperone  42.31 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00512688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00955  hypothetical protein  42.31 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00537151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2699  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.31 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000623101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1053  putativi pili assembly chaperone  42.31 
 
 		 245 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000246739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2652  putativi pili assembly chaperone  41.83 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294251  hitchhiker  0.00357409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  34.65 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  36.5 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  36 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  35.64 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  35.86 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36.5 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  36 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  35.5 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  35.82 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  35.35 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.35 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  35.35 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  35.35 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  35.82 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  35.82 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  35.35 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  35.82 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  35.35 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  35.35 
 
 		 224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  34.88 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  35.38 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  33.67 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  35.38 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.38 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  35.75 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  35.38 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  33.64 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  35.38 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  33.01 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  35.38 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  35.38 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  35.61 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  35.61 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  35.27 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  35.61 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  33.96 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  36.07 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.18 
 
 		 265 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  33.17 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.27 
 
 		 241 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34.91 
 
 		 251 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.1 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  33.02 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  31.94 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  34.65 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.13 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  34.91 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.65 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.39 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  28.16 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.15 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  36.62 
 
 		 257 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  32.87 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  29.56 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  31.1 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.02 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  33.02 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.17 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  30.99 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  32.23 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.23 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  30.99 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.02 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  33.02 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  30.99 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.66 
 
 		 248 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  28.37 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.17 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  31.6 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.17 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.17 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  28.04 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  36.42 
 
 		 260 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.54 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  30.54 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.42 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  30.62 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.18 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  29.06 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  30.54 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  29.63 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>