293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0004 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  93.46 
 
 		 428 aa  805    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  93.22 
 
 		 428 aa  803    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  93.46 
 
 		 428 aa  805    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  91.1 
 
 		 428 aa  808    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  80.05 
 
 		 429 aa  694    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  83.29 
 
 		 429 aa  737    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  78.12 
 
 		 429 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  80.52 
 
 		 429 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  99.53 
 
 		 428 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  93.46 
 
 		 428 aa  805    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  99.3 
 
 		 428 aa  878    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  99.3 
 
 		 428 aa  878    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  93.22 
 
 		 428 aa  803    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  100 
 
 		 428 aa  883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  78.82 
 
 		 429 aa  702    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  99.3 
 
 		 428 aa  878    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  93.22 
 
 		 428 aa  803    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  93.46 
 
 		 428 aa  805    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  82.12 
 
 		 426 aa  727    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  81.88 
 
 		 429 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  82.12 
 
 		 429 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  93.46 
 
 		 428 aa  805    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  93.22 
 
 		 428 aa  803    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  67.68 
 
 		 425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  67.14 
 
 		 425 aa  598  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  66.9 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  67.52 
 
 		 426 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  67.29 
 
 		 426 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  67.14 
 
 		 426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  65.49 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  60.33 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  60.55 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  60.33 
 
 		 427 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  60.33 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  60.33 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  60.33 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  57.58 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  57.38 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  59.38 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  59.14 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  58.73 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  57.24 
 
 		 426 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  57.11 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  59.14 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  45.39 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  46.78 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  42.26 
 
 		 434 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  43.55 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  43.34 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  42.36 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  43.02 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  43.38 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  44.11 
 
 		 438 aa  324  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  41.38 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  41.38 
 
 		 439 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  42.54 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  42.82 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  42.09 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  39.49 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  36.69 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  38.75 
 
 		 428 aa  279  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  38.85 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  35.32 
 
 		 465 aa  262  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  39.8 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  37.47 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  34.98 
 
 		 460 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  34.7 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  35.13 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  33.18 
 
 		 463 aa  249  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  33.18 
 
 		 463 aa  249  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  33.18 
 
 		 468 aa  249  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  37.24 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  35.68 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  40.7 
 
 		 434 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  34.06 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  34.51 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  34.97 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  33.62 
 
 		 461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  33.77 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  33.62 
 
 		 461 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  34.74 
 
 		 470 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  33.33 
 
 		 461 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  35.39 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.35 
 
 		 469 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  35.39 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  35.16 
 
 		 469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  34.32 
 
 		 471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  35.16 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.13 
 
 		 469 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  33.04 
 
 		 470 aa  239  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  35 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  35.54 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  34.6 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  35.28 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  35.29 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>