More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4848 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  86.03 
 
 
410 aa  709    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  86.03 
 
 
410 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4884  multidrug resistance protein MdtM  86.76 
 
 
410 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4920  multidrug resistance protein MdtM  99.76 
 
 
413 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.998541  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4848  multidrug resistance protein MdtM  100 
 
 
413 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  86.76 
 
 
410 aa  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  86.52 
 
 
410 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  86.03 
 
 
410 aa  709    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4922  multidrug resistance protein MdtM  99.76 
 
 
413 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.353329  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4872  multidrug resistance protein MdtM  99.76 
 
 
413 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.891982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  85.43 
 
 
408 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5851  multidrug resistance protein MdtM  87.01 
 
 
410 aa  716    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.720836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4565  multidrug resistance protein MdtM  86.76 
 
 
410 aa  714    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4774  multidrug resistance protein MdtM  99.76 
 
 
413 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.158436  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  40.86 
 
 
409 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  42.35 
 
 
415 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  40.61 
 
 
409 aa  319  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  40.41 
 
 
386 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  39.75 
 
 
410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  39.49 
 
 
410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  39.49 
 
 
410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  39.49 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  39.49 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  39.49 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  39.49 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  40 
 
 
411 aa  306  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0938  multidrug resistance protein MdtM  42.13 
 
 
410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1018  multidrug resistance protein MdtM  42.13 
 
 
410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283578  normal  0.445773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0902  multidrug resistance protein MdtM  42.13 
 
 
410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0999  multidrug resistance protein MdtM  42.13 
 
 
410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0970  multidrug resistance protein MdtM  42.13 
 
 
410 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  36.9 
 
 
413 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  35.81 
 
 
414 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  36.62 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  35.73 
 
 
414 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  35.43 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  36.36 
 
 
415 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  35.43 
 
 
426 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  27.44 
 
 
407 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  22.48 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.6 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 
386 aa  110  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.39 
 
 
401 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 
411 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.82 
 
 
393 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.21 
 
 
398 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.34 
 
 
394 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.09 
 
 
394 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.27 
 
 
411 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.37 
 
 
405 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  25 
 
 
403 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.39 
 
 
402 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.39 
 
 
402 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.05 
 
 
402 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.63 
 
 
420 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  26.85 
 
 
392 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 
394 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  27.01 
 
 
392 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.86 
 
 
429 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 
408 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.85 
 
 
411 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  29.46 
 
 
402 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
401 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 
465 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.89 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.1 
 
 
430 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.85 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  28.44 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  29.91 
 
 
399 aa  96.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.78 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 
426 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.76 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.32 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  28.83 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.64 
 
 
408 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  28.83 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.28 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.65 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2460  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.65 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  29.6 
 
 
403 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  27.56 
 
 
396 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  29.6 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  29.6 
 
 
403 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  29.6 
 
 
403 aa  94  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.64 
 
 
409 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  29.6 
 
 
403 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  29.6 
 
 
403 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.6 
 
 
403 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  29.6 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  30.42 
 
 
396 aa  94  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.77 
 
 
498 aa  93.6  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.89 
 
 
409 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.88 
 
 
392 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.8 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>