126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4821 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  100 
 
 
382 aa  784  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3152  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  61.07 
 
 
141 aa  165  1e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.218767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  31 
 
 
390 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  35.12 
 
 
386 aa  140  4e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  35.12 
 
 
394 aa  130  4e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  40.36 
 
 
394 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  unclonable  2.52983e-14 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  32.47 
 
 
396 aa  122  1e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  27.4 
 
 
290 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  40.38 
 
 
401 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  34.27 
 
 
414 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  36.24 
 
 
1285 aa  97.4  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  28.76 
 
 
430 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.73 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  23.59 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  27.13 
 
 
403 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  1.92379e-05 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  25.59 
 
 
426 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  44.06 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  32.77 
 
 
556 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.41 
 
 
422 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  31.93 
 
 
616 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  25.23 
 
 
426 aa  85.9  1e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  24.44 
 
 
364 aa  85.9  1e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1576  type I restriction-modification system, S subunit  29.6 
 
 
399 aa  83.2  7e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  25.62 
 
 
409 aa  82  1e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  24.77 
 
 
418 aa  81.3  3e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  32.54 
 
 
528 aa  80.5  4e-14  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  30.17 
 
 
393 aa  80.5  4e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  23.04 
 
 
429 aa  80.1  6e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  29.82 
 
 
432 aa  79  1e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.24 
 
 
565 aa  79.3  1e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  21.66 
 
 
437 aa  79.3  1e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  32.67 
 
 
438 aa  79  1e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.73 
 
 
408 aa  78.2  2e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  25.77 
 
 
433 aa  78.6  2e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  32.98 
 
 
402 aa  77.8  3e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  28.02 
 
 
397 aa  77.8  3e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  32.91 
 
 
511 aa  77  5e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  28.81 
 
 
387 aa  76.6  6e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.9 
 
 
406 aa  76.3  8e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  22.67 
 
 
438 aa  75.5  1e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  29.05 
 
 
420 aa  76.3  1e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.65 
 
 
520 aa  72  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  31.75 
 
 
363 aa  71.6  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  23.37 
 
 
425 aa  72  2e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  31.51 
 
 
371 aa  71.6  2e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  24.2 
 
 
409 aa  70.1  5e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  38.18 
 
 
476 aa  69.3  1e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  30.18 
 
 
426 aa  68.2  3e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  29.52 
 
 
450 aa  67.4  4e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.05 
 
 
477 aa  64.7  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  28.93 
 
 
417 aa  64.3  3e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  26.92 
 
 
267 aa  64.3  4e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  22.04 
 
 
407 aa  63.9  4e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  22.04 
 
 
407 aa  63.9  5e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  27.03 
 
 
435 aa  63.2  8e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59098e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  28.37 
 
 
285 aa  62.8  9e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  26.74 
 
 
1343 aa  62.8  1e-08  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  25.43 
 
 
405 aa  62.4  1e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  24.54 
 
 
454 aa  62.4  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  27.17 
 
 
834 aa  62.4  1e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.05 
 
 
620 aa  61.6  2e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.29 
 
 
417 aa  61.2  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.83293e-08 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  22.25 
 
 
417 aa  61.2  3e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  26.52 
 
 
428 aa  60.5  5e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  24.31 
 
 
392 aa  60.5  5e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.88 
 
 
424 aa  60.1  6e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  23.94 
 
 
395 aa  59.7  9e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  24.83 
 
 
413 aa  58.9  1e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  22.69 
 
 
456 aa  58.5  2e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.2 
 
 
457 aa  58.5  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  26.75 
 
 
400 aa  58.2  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  23.5 
 
 
393 aa  58.5  2e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  26.29 
 
 
211 aa  58.5  2e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
428 aa  58.5  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  25.14 
 
 
440 aa  58.2  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  21.32 
 
 
456 aa  58.5  2e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.69 
 
 
462 aa  58.5  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.57 
 
 
471 aa  58.5  2e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  27.32 
 
 
402 aa  58.2  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.86 
 
 
429 aa  57.4  4e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  23.81 
 
 
439 aa  57.4  5e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1851  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  24.85 
 
 
194 aa  56.6  6e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.71 
 
 
385 aa  56.6  6e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.54 
 
 
423 aa  56.2  8e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.75 
 
 
419 aa  55.5  1e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  28.18 
 
 
416 aa  55.8  1e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  26.23 
 
 
420 aa  55.8  1e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 
400 aa  55.5  1e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  23.19 
 
 
422 aa  55.8  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  24.61 
 
 
417 aa  55.1  2e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.71 
 
 
413 aa  54.3  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.04 
 
 
419 aa  53.5  6e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  24.03 
 
 
846 aa  53.1  7e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
391 aa  53.1  7e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  27.78 
 
 
419 aa  52.8  1e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.85 
 
 
442 aa  52.8  1e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.14 
 
 
427 aa  51.6  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  22.09 
 
 
416 aa  51.6  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  28.85 
 
 
406 aa  51.6  2e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.12 
 
 
642 aa  51.2  3e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.19621e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>