138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4783 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  67.26 
 
 
895 aa  1237  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  100 
 
 
890 aa  1833  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  99.33 
 
 
890 aa  1825  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  58.33 
 
 
689 aa  653  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  35.41 
 
 
878 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  33.73 
 
 
899 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.52 
 
 
955 aa  402  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  34.56 
 
 
950 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  34.38 
 
 
958 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  34.38 
 
 
958 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  34.69 
 
 
953 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  34.51 
 
 
953 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  39.18 
 
 
582 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  35 
 
 
955 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
929 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  38.7 
 
 
591 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  34.87 
 
 
950 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  39.86 
 
 
631 aa  365  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  35.64 
 
 
911 aa  350  5e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  37.39 
 
 
845 aa  321  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  38.28 
 
 
580 aa  308  4e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  35.95 
 
 
676 aa  305  3e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  38.21 
 
 
515 aa  303  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  30.49 
 
 
979 aa  287  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  35.53 
 
 
633 aa  283  7e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  36.72 
 
 
930 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  47.32 
 
 
681 aa  279  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  47 
 
 
681 aa  277  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.69 
 
 
678 aa  272  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  34.96 
 
 
627 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  34 
 
 
658 aa  264  5e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  32.92 
 
 
841 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.99 
 
 
556 aa  241  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  30.59 
 
 
1051 aa  235  2e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  46.08 
 
 
763 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  45.77 
 
 
763 aa  231  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  33.19 
 
 
574 aa  229  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  46.69 
 
 
273 aa  217  1e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  33.06 
 
 
711 aa  210  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  39.19 
 
 
295 aa  203  1e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.87 
 
 
713 aa  202  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  31.65 
 
 
553 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  38.12 
 
 
775 aa  181  5e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  38.17 
 
 
775 aa  178  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  35.96 
 
 
777 aa  177  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  37.97 
 
 
777 aa  175  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.73638e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  35.85 
 
 
776 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  37.3 
 
 
777 aa  170  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  37.07 
 
 
777 aa  168  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  43.75 
 
 
280 aa  165  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  36.76 
 
 
777 aa  165  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  36.76 
 
 
777 aa  165  4e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  33.73 
 
 
368 aa  149  2e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  27.58 
 
 
443 aa  118  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  31.45 
 
 
338 aa  109  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  29.38 
 
 
321 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  38.12 
 
 
813 aa  97.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  27.51 
 
 
580 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  37.72 
 
 
277 aa  94.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  37.35 
 
 
848 aa  93.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  35.6 
 
 
746 aa  92.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  35.96 
 
 
782 aa  91.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.38 
 
 
986 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  33.14 
 
 
383 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  31.15 
 
 
842 aa  88.6  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  30.29 
 
 
309 aa  87.8  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  30.92 
 
 
1580 aa  86.3  3e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  40.43 
 
 
1077 aa  84.7  7e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  30.77 
 
 
1448 aa  84  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  30.4 
 
 
1448 aa  83.6  2e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  26.75 
 
 
897 aa  82.8  3e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  33.56 
 
 
272 aa  80.9  1e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  41.44 
 
 
847 aa  80.5  1e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  50 
 
 
269 aa  79.7  2e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  33.33 
 
 
739 aa  79.7  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  33.54 
 
 
278 aa  80.1  2e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  77.8  8e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  30.05 
 
 
778 aa  77.8  9e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  34.35 
 
 
275 aa  77.8  9e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  23.19 
 
 
597 aa  74.7  8e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  23.19 
 
 
597 aa  74.7  8e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  31 
 
 
818 aa  74.3  9e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  25.09 
 
 
597 aa  74.3  9e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  28.96 
 
 
336 aa  73.9  1e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  29.85 
 
 
297 aa  74.3  1e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  28.26 
 
 
987 aa  73.6  2e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.25 
 
 
970 aa  73.2  2e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  34.25 
 
 
621 aa  72.8  3e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  40.31 
 
 
271 aa  72.8  3e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  34.25 
 
 
354 aa  72.8  3e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  35.05 
 
 
736 aa  72.4  3e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.25 
 
 
970 aa  72  4e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  34.39 
 
 
797 aa  71.2  8e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  29.61 
 
 
303 aa  70.5  1e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  31.82 
 
 
326 aa  70.5  1e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  30.32 
 
 
1557 aa  69.7  2e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  39.17 
 
 
866 aa  69.7  2e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  33.54 
 
 
744 aa  68.9  4e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  32.97 
 
 
357 aa  67.4  1e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  33.93 
 
 
1495 aa  66.6  2e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>