More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4699 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  100 
 
 
477 aa  976    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  73.88 
 
 
475 aa  735    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  63.54 
 
 
485 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  44.12 
 
 
480 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  43.93 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  41.63 
 
 
491 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  41.63 
 
 
491 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  41.63 
 
 
491 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  41.63 
 
 
491 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  41.63 
 
 
491 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  41.63 
 
 
491 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  41.63 
 
 
491 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  41.48 
 
 
491 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  43.18 
 
 
448 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  38.43 
 
 
466 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  37.95 
 
 
468 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  37.04 
 
 
467 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.48 
 
 
457 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35 
 
 
480 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  33.33 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.37 
 
 
450 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  35.05 
 
 
474 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  33.98 
 
 
478 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  36.55 
 
 
441 aa  276  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.58 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  33.78 
 
 
448 aa  272  9e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  33.55 
 
 
466 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  33.55 
 
 
475 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  31.19 
 
 
493 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.45 
 
 
438 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  33.26 
 
 
442 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.92 
 
 
457 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  30.57 
 
 
504 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  31.85 
 
 
486 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  33.12 
 
 
475 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  31.21 
 
 
479 aa  256  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  33.47 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  32.99 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  30.87 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  32.99 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  32.99 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.14 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  32.69 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.03 
 
 
444 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  32.97 
 
 
443 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  30.33 
 
 
485 aa  253  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  31.01 
 
 
479 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  29.42 
 
 
499 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  31.06 
 
 
469 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.7 
 
 
468 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  33.19 
 
 
468 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  32.91 
 
 
482 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  30.94 
 
 
492 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  30.87 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  32.55 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  36.88 
 
 
463 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  32.27 
 
 
468 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  31.57 
 
 
472 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.77 
 
 
482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  36.66 
 
 
463 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  30.09 
 
 
445 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  28.39 
 
 
544 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  32.21 
 
 
443 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  31.22 
 
 
477 aa  237  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.52 
 
 
480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  30.79 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  32.81 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.95 
 
 
533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  31.8 
 
 
474 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  32.55 
 
 
497 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  31.74 
 
 
437 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  30.67 
 
 
496 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  31.94 
 
 
471 aa  229  8e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.22 
 
 
480 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  35.19 
 
 
458 aa  228  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  30.54 
 
 
474 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  29.55 
 
 
477 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  29.09 
 
 
497 aa  226  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.33 
 
 
476 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  31.33 
 
 
450 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  27.6 
 
 
487 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  31.57 
 
 
491 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.19 
 
 
465 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  32.08 
 
 
479 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  33.85 
 
 
516 aa  223  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  31.97 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  31.97 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  31.97 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  31.97 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  31.49 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  31.97 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  30.87 
 
 
480 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  31.75 
 
 
490 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  30.47 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  30.9 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  30.9 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  30.9 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  30.9 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  30.9 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  30.9 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>