More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4197 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.54 
 
 
431 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  100 
 
 
431 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.07 
 
 
431 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  98.84 
 
 
447 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  98.61 
 
 
431 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.65 
 
 
396 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.39 
 
 
395 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.39 
 
 
396 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.65 
 
 
395 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  50.13 
 
 
398 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  48.22 
 
 
411 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  48.22 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  47.84 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  47.49 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  48.09 
 
 
411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  48.35 
 
 
411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  47.72 
 
 
411 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  46.48 
 
 
438 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  47.72 
 
 
411 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  48.22 
 
 
411 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  47.46 
 
 
411 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  47.68 
 
 
407 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  46.21 
 
 
408 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  47.58 
 
 
405 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  46.21 
 
 
408 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  46.87 
 
 
381 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  45.96 
 
 
408 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  47.9 
 
 
397 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 
398 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 
398 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 
398 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 
398 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 
398 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  44.92 
 
 
433 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  44.7 
 
 
435 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  44.7 
 
 
435 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 
435 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  43.78 
 
 
414 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  46.39 
 
 
440 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  47.09 
 
 
414 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  42.75 
 
 
444 aa  346  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  43.08 
 
 
391 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  43.08 
 
 
391 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  41.79 
 
 
385 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  42.82 
 
 
391 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 
385 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  41.54 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  41.54 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  41.54 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  41.28 
 
 
385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  44.07 
 
 
431 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 
428 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 
393 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 
410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 
410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  38.66 
 
 
383 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 
402 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  34.21 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  34.21 
 
 
394 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  34.21 
 
 
394 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.42 
 
 
394 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 
367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 
369 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  32.63 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
370 aa  195  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 
374 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  32.89 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1761  radical SAM domain protein  33.03 
 
 
214 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.33 
 
 
380 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 
436 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
366 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  22.54 
 
 
436 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 
383 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 
800 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 
389 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 
378 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.27 
 
 
381 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 
385 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  24 
 
 
460 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  21.79 
 
 
393 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 
401 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 
376 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  22.69 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
377 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  32.37 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  28.25 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 
431 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4133  hypothetical protein  27.31 
 
 
176 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  26.74 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4012  f165  27.31 
 
 
176 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 
290 aa  87.4  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>