More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4015 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  91.4 
 
 
500 aa  821    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  91.4 
 
 
500 aa  821    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  91.55 
 
 
497 aa  816    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  98.8 
 
 
500 aa  974    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  99.4 
 
 
500 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03494  hypothetical protein  91.4 
 
 
500 aa  821    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  89.36 
 
 
499 aa  798    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  91.55 
 
 
497 aa  816    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5098  sensory histidine kinase UhpB  91 
 
 
501 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.118457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  99.2 
 
 
500 aa  979    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  91.55 
 
 
497 aa  816    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  91.4 
 
 
500 aa  821    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  80.72 
 
 
505 aa  705    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  90.6 
 
 
500 aa  807    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.406028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  100 
 
 
500 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  99.6 
 
 
500 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  43.03 
 
 
500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  45.24 
 
 
509 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  45.04 
 
 
509 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  45.04 
 
 
509 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  47.64 
 
 
513 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
513 aa  259  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  35.09 
 
 
527 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  36.65 
 
 
525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  35.56 
 
 
514 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
519 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.57 
 
 
466 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  35.96 
 
 
490 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  39.05 
 
 
486 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  36.4 
 
 
373 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
573 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  37.61 
 
 
448 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.75 
 
 
466 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
552 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.33 
 
 
598 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
703 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
560 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
598 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  34.67 
 
 
452 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
412 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
485 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.09 
 
 
683 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  34.22 
 
 
458 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
472 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
770 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
490 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  30.49 
 
 
439 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  34.26 
 
 
387 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
366 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
671 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
480 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
658 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
450 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
775 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  31.42 
 
 
447 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  32.52 
 
 
575 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  32.52 
 
 
575 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  32.52 
 
 
575 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
496 aa  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  32.03 
 
 
772 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
700 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.76 
 
 
662 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  33.48 
 
 
640 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
479 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
468 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.56 
 
 
325 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
1168 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  29.27 
 
 
619 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
662 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  38.03 
 
 
485 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
775 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  29.27 
 
 
680 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  29.27 
 
 
680 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
561 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  34.22 
 
 
475 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  38.07 
 
 
460 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
700 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
700 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  32.39 
 
 
461 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.87 
 
 
388 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
401 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  31.95 
 
 
740 aa  100  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
475 aa  100  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.02 
 
 
323 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
370 aa  100  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 
480 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 
480 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  34.87 
 
 
403 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  33.5 
 
 
459 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
703 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  33.67 
 
 
351 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  35.38 
 
 
470 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.96 
 
 
391 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>