More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3543 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  97.3 
 
 
590 aa  1165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  71.43 
 
 
605 aa  861  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  63.3 
 
 
592 aa  763  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  61.53 
 
 
611 aa  743  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  75.34 
 
 
599 aa  922  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  97.45 
 
 
589 aa  1145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  64.36 
 
 
596 aa  759  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  97.96 
 
 
589 aa  1150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  93.29 
 
 
594 aa  1097  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  94.91 
 
 
589 aa  1093  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  62.19 
 
 
611 aa  750  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  63.65 
 
 
602 aa  758  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  60.51 
 
 
690 aa  701  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  63.51 
 
 
596 aa  756  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  64.86 
 
 
599 aa  789  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  1.18523e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  62.73 
 
 
607 aa  751  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  66.1 
 
 
597 aa  776  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2893  oxaloacetate decarboxylase  68.54 
 
 
592 aa  808  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345555  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  62.1 
 
 
594 aa  729  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  66.16 
 
 
595 aa  793  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  97.97 
 
 
590 aa  1170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  60.77 
 
 
604 aa  742  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  97.3 
 
 
590 aa  1165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  65.37 
 
 
595 aa  763  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  100 
 
 
589 aa  1199  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  63.19 
 
 
599 aa  752  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  99.15 
 
 
589 aa  1188  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  62.9 
 
 
607 aa  758  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  60.24 
 
 
690 aa  703  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  63.24 
 
 
606 aa  762  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  62.71 
 
 
601 aa  758  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  60.3 
 
 
604 aa  733  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  63.36 
 
 
608 aa  754  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  61.53 
 
 
611 aa  734  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  96.62 
 
 
591 aa  1127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  98.13 
 
 
589 aa  1181  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  97.29 
 
 
591 aa  1135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  61.73 
 
 
602 aa  755  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  97.28 
 
 
588 aa  1145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  63.07 
 
 
607 aa  757  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  60.78 
 
 
592 aa  731  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  65.94 
 
 
594 aa  789  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  96.45 
 
 
591 aa  1105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  65.88 
 
 
593 aa  780  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  63.35 
 
 
604 aa  761  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  62.77 
 
 
603 aa  748  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  63.24 
 
 
598 aa  767  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  50.16 
 
 
604 aa  584  1e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  50 
 
 
602 aa  582  1e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  49.43 
 
 
608 aa  582  1e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  50.65 
 
 
602 aa  584  1e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  50.33 
 
 
602 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  50.08 
 
 
599 aa  576  1e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  47.67 
 
 
609 aa  577  1e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  49.59 
 
 
602 aa  572  1e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  49.84 
 
 
602 aa  572  1e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  49.59 
 
 
602 aa  572  1e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  49.84 
 
 
602 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1740  hypothetical protein  49.75 
 
 
596 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.407057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  49.51 
 
 
607 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  49.67 
 
 
607 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  50.08 
 
 
602 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  49.24 
 
 
571 aa  567  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  49.67 
 
 
602 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  48.47 
 
 
569 aa  564  1e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  46.87 
 
 
617 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  47.96 
 
 
569 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  48.3 
 
 
569 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  48.13 
 
 
615 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  47.96 
 
 
567 aa  557  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  49.41 
 
 
582 aa  555  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  47.37 
 
 
568 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  45.93 
 
 
573 aa  548  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  49.74 
 
 
567 aa  551  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  47.42 
 
 
596 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  47.42 
 
 
596 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1736  oxaloacetate decarboxylase  54.03 
 
 
510 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  46.69 
 
 
582 aa  531  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  46.63 
 
 
582 aa  531  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0701  oxaloacetate decarboxylase  55.11 
 
 
465 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  47.11 
 
 
579 aa  530  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  46.58 
 
 
587 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  46.81 
 
 
584 aa  526  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1582  oxaloacetate decarboxylase  56 
 
 
465 aa  528  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  44.18 
 
 
634 aa  515  1e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.14042e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  41.97 
 
 
633 aa  512  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  46.1 
 
 
577 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  43.2 
 
 
616 aa  507  1e-142  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  45.41 
 
 
577 aa  504  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  46.69 
 
 
614 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  43.22 
 
 
624 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.43186e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3084  oxaloacetate decarboxylase  51 
 
 
499 aa  493  1e-138  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.01568e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0033  oxaloacetate decarboxylase  51 
 
 
499 aa  493  1e-138  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000614565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3026  oxaloacetate decarboxylase  50.2 
 
 
520 aa  495  1e-138  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.444345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1284  pyruvate carboxylase subunit B  44.89 
 
 
618 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.01303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  48.07 
 
 
475 aa  488  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0316  oxaloacetate decarboxylase  49.8 
 
 
501 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1319  Conserved carboxylase region  51.11 
 
 
463 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0334  oxaloacetate decarboxylase  49.6 
 
 
501 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.849727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2433  oxaloacetate decarboxylase  51.22 
 
 
470 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>