More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3267 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  91.01 
 
 
378 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  91.53 
 
 
378 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  91.01 
 
 
378 aa  716    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  91.27 
 
 
378 aa  715    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  98.68 
 
 
378 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  80.59 
 
 
376 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  98.68 
 
 
378 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  81.75 
 
 
379 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  89.95 
 
 
380 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  80.59 
 
 
376 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  82.01 
 
 
379 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  98.68 
 
 
378 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  90.74 
 
 
378 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  91.53 
 
 
378 aa  717    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  80.59 
 
 
376 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
378 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  99.47 
 
 
378 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  91.27 
 
 
378 aa  715    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  91.27 
 
 
378 aa  715    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  90.48 
 
 
378 aa  711    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  81.08 
 
 
380 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  80.95 
 
 
379 aa  629  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  78.84 
 
 
378 aa  620  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  67.01 
 
 
391 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  63.66 
 
 
390 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  64.74 
 
 
386 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  63.66 
 
 
392 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  61.84 
 
 
392 aa  504  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.32 
 
 
396 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.95 
 
 
379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.24 
 
 
379 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.09 
 
 
385 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.36 
 
 
385 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.41 
 
 
380 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.36 
 
 
385 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.02 
 
 
387 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.67 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000575717  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3031  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.67 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  57.03 
 
 
378 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  59.09 
 
 
385 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.13 
 
 
388 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000324324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3189  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.67 
 
 
388 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000939892  normal  0.198948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.56 
 
 
378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3668  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.84 
 
 
388 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.231493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1121  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.35 
 
 
378 aa  448  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.002803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2483  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  58.78 
 
 
379 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274904  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.38 
 
 
400 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0479  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.89 
 
 
385 aa  429  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  54.5 
 
 
391 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  55.73 
 
 
386 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  53.66 
 
 
401 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03095  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.94 
 
 
341 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.453176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  55.32 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  55.15 
 
 
391 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  55.32 
 
 
384 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  55.03 
 
 
391 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  55.29 
 
 
404 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  57.8 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.84 
 
 
387 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  53.85 
 
 
380 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  55.29 
 
 
404 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 
395 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.32 
 
 
382 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.14 
 
 
400 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  51.44 
 
 
404 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  51.44 
 
 
404 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  51.44 
 
 
404 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 
392 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  51.85 
 
 
385 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.75 
 
 
389 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  51.44 
 
 
404 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  51.18 
 
 
404 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  51.44 
 
 
404 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.48 
 
 
396 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  50.92 
 
 
404 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  51.3 
 
 
419 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
393 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  51.04 
 
 
413 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.21 
 
 
394 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  49.09 
 
 
409 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
408 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  48.83 
 
 
409 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
404 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3308  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  53.49 
 
 
390 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
405 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
405 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
405 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
405 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  51.32 
 
 
383 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
405 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  50.52 
 
 
405 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  51.59 
 
 
383 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  47.72 
 
 
375 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.31 
 
 
375 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  49.48 
 
 
405 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  49.48 
 
 
400 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2322  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.48 
 
 
388 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  49.73 
 
 
399 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  49.21 
 
 
422 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>